소 모색관련 MC1R 유전자의 SNP와 관련한 3'-tailed primer를 이용한 한우육의 판별
Identification of Hanwoo Using 3'-tailed Primer Associated with Single Nucleotide Polymorphism (SNP) in Melanocortin 1 Receptor (MC1R) gene
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초록
이전에 연구된 한우육과 Holstein 및 Black angus육 감별법의 신속성, 편리성, 경제성 등의 단점을 보완하기 위해 소의 MC1R gene의 SNP를 이용한 새로운 감별법을 시도하였다.본 연구에서는 소의 MC1R gene 중 594번째 염기인 Guanine이 한우에서는 결실된 점을 이용하여 한우의 sequence를 바탕으로 3'쪽에 2mers의 tail을 달아 한우에게는 상보적이나 다른 종에서는 상보적이지 않은 3'-tailed primers를 제작하였다. 이 primer들을 이용해서 한우에서만 MC1R 중 571번째 염기서열부터 919번째 염기서열까지의 343bp의 단편이 증폭되도록 하였다. 그 결과, Holstein, Black angus에서는 모두 band가 관찰되지 않았으나 한우에서는 343bp의 band가 확인되었다. 따라서 본 연구에서 사용한 3'-tailed primer를 이용하면 보다 정확하고 재현성 있으며 신속하고 편리하며 경제적인 한우육의 감별이 될 것으로 판단된다.
Abstract
To improve the methods used for the identification of Hanwoo, we performed a PCR using 3’-tailed primer associated with single nucleotide polymorphism(SNP) in Melanocortin 1 receptor(MC1R) gene. MC1R plays an important role in melanin synthesis and the SNP within MC1R was used as a target for PCR- RFLP studies previously. A forward 3’-tailed primer, which matches with the template DNA of Hanwoo but not with others(black- haired; Holstein and Black angus) at the site of 594th base sequence, and one reverse primer were designed for this study. When use this primer set, a size of 343bp was amplified by PCR only in Hanwoo, not in Holstein and Black angus. This result suggests that the PCR using our 3'-tailed primer would be very accurate, easy, reproducible and economic method to discriminate between Hanwoo meat and other black-haired ones.
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