cDNA microarray를 이용한 HPV-16 E6와 연관된 유전자의 발현 분석

목적 : 이 연구는 자궁경부암의 주요 발암 원인 인자로 알려진 HPV-16 E6의 발현이 세포내 유전자들의 전사조절에 미치는 영향을 관찰하기 위해서 시행되었다.연구 방법 : HPV-16 E6를 안정적으로 발현하는 A549E6와 RC10.1 세포주를 실험군으로 사용하여 cDNA microarray 실험을 시행하였다.결과 : A549E6 세포주에서 HPV-16 E6의 세포내 발현으로 증가된 발현양상을 보인 주요 유전자들로는 GTPase-activating protein Rho 4, transcription factor D2, IKAROS, integrin-α 6, cadherin 11, ephrin-β 2, RAN binding protein 2, branched-chain amino transferase 2 등이 있었으며, 감소된 발현양상을 보인 주요 유전자들로는 K-ras 2, CDC (cell division cycle) 37, CDC16, CDC7L1, IRF3, interferon- -inducible protein 30, cadherin 6, desmoglein 1, desmocollin 2, endothelin 2 등이 있었다. RC10.1 세포주에서 증가된 발현양상을 보인 주요 유전자들로는 colon cancer familial nonpolyposis type 1 (COCA 1), Bcl 2, jagged 1, MAP2K6, E2F1, ephrin receptor-β 2, ephrin-β 2, desmoglein 1, transforming growth factor-β 3 등이 있었으며, 감소된 발현양상을 보인 주요유전자들로는 KIT, Rad51C, Bcl 2 antagonist killer 1, STAT 4, epidermal growth factor receptor, high mobility group protein 2, cadherin 11, cadherin 12, cadherin 3, integrin-α 1, intergrin-α 8, chromosome segregation 1-like 등이 있었다.