Dynal RELITM SSO HLA-DRB Test 키트를 이용한 HLA-DR 형별 검사의 Ambiguity 분석 및 한국형 해석 프로그램의 개발
Analysis of Ambiguities of HLA-DR Typing using the Dynal RELITM SSO HLA-DRB Kit and Development of an ‘Interpretation Program for Koreans’
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참고문헌
초록
배경 : Reverse-SSO (sequence specific oligonucleotide)를이용하는 HLA-DR 검사 키트가 널리 사용되고 있으나, 이를 이용할 경우 결과의 상당 부분에서 저해상도 수준의 HLA-DRB1형별 판정에 애매함(ambiguity)을 보여 정확한 결과 판정에 어려움이 있다. 본 연구에서는 Dynal RELITM SSO HLA-DRB(이하 Dynal DRB) 검사의 ambiguity에 대해 분석한 후 한국형해석 프로그램을 개발하여 적용해 보았다.방법 : 한국인 3,0명을 대상으로 36 probe Dynal DRB 키트(1998 HLA 명법)를 이용하여 HLA-DRB1/B3/B4/B5 형별 검사를 실시하였고 HLA-DRB1 형별 판정에서 ambiguity를보인 예에 대해 모두 PCR-SSCP (single-strand conformationpolymorphism)로 확인한 결과와 비교하였다. 이를 바탕으로 45probe Dynal DRB (2001. 1. HLA 명법) 검사에 대한 국형 해석 프로그램을 개발하였다.결과 : 전체 3,000명에 대한 36 probe Dynal DRB 검사 결과456예(15.2%)에서 DRB1 형별 판정에 ambiguity를 보였다.Ambiguity를 보인 경우에 실제로 PCR-SSCP를 시행하여 확인한 결과는 한국인의 DRB1 대립유전자 빈도와 DRB1-DRB3/B4/B5 연관성에 근거하여 예상한 결과(‘most probable type’)와 모두 일치하였으며 이러한 원리를 응용한 한국형 해석프로그램을 Dynal DRB 검사 판독에 적용하여 36 probe Dynal DRB검사의 ambiguity 중 95.0% (433/456예), 전체 검사 건수의99.2% (433/3,000예)에서, 그리고 45 probe Dynal DRB 검사의 99.4% (348/350예)에서 추가검사 없이 정확한 HLA-DR 형별 판정이 가능하였다.