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논문KCI 등재

HLA Class I DNA 검사용 시약 BioSewoomTM HLA-A, -B, -CPCR/SSP의 평가

Evaluation of BioSewoomTM HLA-A, -B, -C PCR/SSP Kit

김명희|최성은|정희정|오흥범|차충환
대한진단검사의학회 (Korean Society For Laboratory Medicine)|2007.10|Annals of Laboratory Medicine|제27권 제5호|pp. 360-368

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2HLASSP-B
주제분류병리학

초록

배경 : HLA 형별판정을 위해 중합효소연쇄반응(polymerasechain reaction, PCR)에 기반을 둔 DNA 검사법들이 기존의 혈청학적 검사법을 빠르게 대치하고 있다. 본 연구에서는 최근 국내에서 개발된 PCR-SSP 기법의 BioSewoomTM HLA-A, -B, -CPCR/SSP Kit (BioSewoom SSP)를 평가하였다.방법 : 국내외 정도관리 프로그램에 사용된 158검체로 BioSe-woom SSP를 이용하여 형별검사를 시행하고 그 결과를 일치결과(consensus)와 비교한 후 일치율 및 미확정(ambiguity) 정도를 파악하였다. 또한, 유전자좌별로 각각 20개의 한국인 검체에대해 reverse-SSOP 방법인 INNO-LiPA HLA-A, -B, -CTyping Kit (INNO-LiPA, Innogenetics, Belgium)와 BioSe-woom SSP로 검사를 시행한 후 그 결과를 비교하였다. 결과 : 21개의 국내 신빙도조사 검체는 HLA-A 4예(19.0%),HLA-B 6예(28.6%), HLA-C 1예(4.8%)에서 두 개 이상의 결과를 보였으나 한국인의 대립유전자 빈도를 고려한 경우 모두 정확한 형별판정이 가능하였다. 137예의 국외 정도관리 검체는 HLA-A 12예(8.8%), HLA-B 26예(19.0%), HLA-C 6예(4.4%)에서2개 이상의 결과를 보였다. HLA-A, -B, -C 각 20검체씩에대한 BioSewoom SSP와 INNO-LiPA 비교에서 한국인의 대립유전자 빈도를 고려한 경우 모두 일치된 형별판정 결과를 보여주었다. 국내 신빙도조사 21검체, INNO-LiPA와 비교에 사용되었던 유전자좌별 20검체에 대한 BioSewoom SSP 검사 결과, 총1,760개의 PCR 반응 중 12개(0.007%)에서 매우 약한 비특이밴드가 관찰되었으나 무시할 수 있는 정도이었다. 또한 소수(15개PCR 반응, 0.009%)에서 internal control이 증폭되지 않았으나형별판정에 영향을 미치지 않았다.

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