우리 나라 양식 넙치, Paralichthys olivaceus에서 분리된 VHSV(Viral Hemorrhagic Septicemia Virus)의 유전학적 검토
Genetic relationship of the VHSV(Viral Hemorrhagic Septicemia Virus) isolated from cultured olive flounder, Paralichthys olivaceus in Korea
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초록
RT-PCR법을 이용하여, 우리 나라 동해안의 양식 넙치에서 VHSV를 검출하였으며 5개의 VHSV isolates의 N gene과 G gene을 sequencing하였다. Phylogenetic analysis를 실시하여 이들 VHSV isolates와 지리적 분리 유래가 다른 VHSV strains간의 유전학적 상관관계를 조사하였다. 일반적으로 VHSV strains의 유전형은 그 지리적 분리 유래에 따라 American type(Genogroup Ⅰ), British Isles type(Genogroup Ⅱ), European type(Genogroup Ⅲ)으로 구분할 수 있으며, 본 연구에서는 우리 나라 양식 넙치에서 분리한 5개의 Korean isolates는 모두 Genogroup Ⅰ에 속하며, 일본의 Obama25 type과 유사하다는 것을 밝혔다.
Abstract
RT-PCR method was applied to detect and clone the nucleocapsid protein(N) gene and glycoprotein(G) gene for sequencing 5 Korean VHSV isolates from cultured olive flounder, Paralichthys olivaceus. Phylogenetic analysis was performed to investigate their relationship with the VHSV strains described previously and isolated from different geographical area. Generally, VHSV strains were separated phylogenetically according to the major geographical area of isolation: Genogroup Ⅰ(American type), Genogroup Ⅱ(British Isles) and Genogroup Ⅲ(European type). This study revealed that all 5 Korean VHSV isolates were belonged to GenogroupⅠand closely related to Japanese Obama25 type.