Microsatellite를 이용한 한국 보리 유전자원의 유연관계 분석
Diversity and Relationships among Korean Barley (Hordeum vulgare L.) Germplasm by Microsatellite
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참고문헌
초록
본 실험은 한국 재배보리의 분자생물학적 다양성의 차이를 파악하고자 재래종, 도입종 및 육성종보리집단에 대하여 microsatellite을 이용하여 DNA 다형성을 조사하였다. 이러한 DNA 다형성을 통하여 공시집단의 분자생물학적 유연관계를 분석한 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. Microsatellite변이를 이용하여 8개의 primer(HVM3, HVM4, HVM6, HVM7, HVM9, HVM54, HVM67, HVM68)로 한국보리집단의 유전적 다형성 및 유연관계를 분석한 결과, 총대립유전자수는 35개였으며 HVM4에서 7개로 가장 많은 대립유전자수를 보였다. 각 집단별로는 재래종집단에서 28개, 도입종집단에서 26개, 육성종집단에서 28개의 대립유전자를 확인할 수 있었고 HVM3의 199 bp, 261 bp 등 8개의 밴드는 3가지 분류군중 어느 하나의 집단에서만 발견되었다. 2. 분석에 사용된 primer중 HVM3, HVM7, HVM9, HVM 54, HVM67은 재래종, 도입종 또는 육성종중 어느 한쪽에 편중되어 분포하였으며 2 검정에서도 고도의 유의성을 보여 집단구분의 지표로 사용이 가능할 것으로 사료되었다. 3. 재래종, 도입종 및 육성종등 한국 재배보리집단의 유연관계를 Microsatellite 밴드의 양상을 근거로 정준판별분석과 군집분석을 실시하여 한국재래종집단을 분리해낼 수 있었다.
Abstract
This study was conducted to understand the genetic diversity and relationships of Korean cultivated barley groups classified as landrace, improved and introduced varieties by microsatellite variation (SSRP, Simple Sequence Repeats Polymorphism). With the DNA polymorphism, molecular biological relationship and genetic distance within and between groups were analyzed. Total number of alleles was 35 in 8 microsatellite loci and HVM4 locus was the most variable by having 7 alleles. Thers were 28 alleles in the landrace group, 26 alleles in the introduced group and 28 alleles in the improved group for 8 microsatellite loci. Eight alleles, including 199bp of HVM3 primer, were unique bands by showing in only one group. Distribution of alleles in HVM3, HVM7, HVM9, HVM54, HVM67 loci were shown in one of the groups with significantly different at less than 1% level in chi-squired test. Those microsatellite primer pairs can be used to distinguish the Korean landrace barley.
참고문헌 (19)
- "Changes of morphological traits according to period in Korean barley cultivars", 32(4), pp.356~362 (2000)
- "Barley microsatellite: allele variation and mapping.", 27, pp.835~845 (1995)
- "Microsatellite for linkage analysis of genetic traits", pp.288~294 (1992)
- "Locating genotypes and genes for abiotic stress tolerance in barley", 137, pp.141~147 (1997)
- "Choice of method for identifying germplasm with superior alleles", pp.209~216 (1988)
- "Simple sequence repeats for the genetic analysis of apple.", 96, pp.1069~1076 (1998)
- "Mocrosatellite in barley Cytogenetics and Cereal Biotech of Guelph", pp.1~2 (1998)
- "A major mechanism for DNA sequence evolution", e, pp.203~221
- "Identification and mapping of simple sequence repeats in barley", pp.148~ (1996)
- "PCR-amplified microsatellites as markers in plant genetics", pp.175~182
- "Analysis of gene diversity in subdivided population", pp.3321~3323
- "Genetic diversity and environmental associations of wild barley", pp.203~68 213
- "NTSYSpc : Numerical taxonomy and multivariate analysis system. Version 2.0." (1998)
- "Direct comparison of levels of genetic variation among barley accessions detected by RFLPs", 95(4), pp.714~722 (1997)
- "Extraordinarily polymorphic microsatellite DNA in barley", pp.5466~5470
- "Update on north American barley mapping project", pp.1~ (1995)
- "普通型 大麥に於する變種の識別に就て", pp.153~166 (1944)
- "Barley cultivar identification using microsatellites." (1996)
- "Unequal crossing over between homologous chromosomes is not the major mechanism involved in the generation of alleles at VNTR loci", ge(mics 5), pp.382~384