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논문

Microsatellite loci 분석에 의한 한우와 타 품종간의 유전적 유연관계

Assessment of Genetic Diversity and Relationships Between Korean Cattle and Other Cattle Breeds by Microsatellite loci

이승환|오성종|정일정|이학교|박응우|홍기창|윤두학
한국축산학회 (Korean Society of Animal Sciences and Technology)|2005.06|한국축산학회지 (Journal of Animal Science and Technology)|제47권 제3호|pp. 341-354

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HanwooPhylogenetic analysisMicrosatelliteBos indicusBos taurus
주제분류축산학

초록

한우를 포함한 동북아시아 및 중국 내륙지역의 7개 품종, 유럽 Bos taurus 5개 품종, 아프리카 Bos taurus 2개 품종, 아시아 Bos indicus 2개 품종, 아프리카 Bos indicus 2개 품종 및 참고집단으로 인도네시아 반텡종인 Bali cattle의 19개 소품종을 11개 microsatellite markers를 이용하여 유전적 다양성 및 특성, 유전적 거리 추정 및 분지도 작성 등을 통하여 한우를 비롯한 동북아시아 소 품종들에 대한 보다 더 명확한 유전적 유연관계에 대하여 고찰하고자 하였다. 분석된 11개의 microsatellite loci에서 대립유전자의 수는 9개(ILSTS005 및 TGLA227)에서 26개(TGLA122)까지 검출되었고 전체 대립유전자수는 162개로 충분한 유전적 정보를 제공해 주었다. 또한 대립유전자별 빈도에 있어서 품종별 현저한 차이를 보이는 microsatellite loci들이 다수 검출되었다. 품종별 이형질성에 있어 아시아 품종들이 유럽계 및 아프리카 계통의 taurines 보다 높게 나타났으며, 아시아 및 아프리카 indicines 품종보다는 낮게 분석되어졌다. 유전적 거리 추정결과로 한우를 포함한 동북아시아 품종들은 같은 조상에서 유래된 품종 집단으로 추정되고 일부 품종들은 유럽계 품종들의 유전적 영향을 받은 것으로 나타났으며, 그 중 일본 흑모화우가 가장 많은 영향을 받은 것으로 분석되어졌다. 그리고 동북아시아 품종들과 Bos indicus 품종들 간의 유전적 거리가 유럽계통 및 아프리카 계통의 Bos taurus 품종들과 Bos indicus 품종들과의 거리만큼이나 유전적으로 상이하였으며, 유럽계 소 품종 및 아프리카 taurines 품종들과도 어느 정도의 유전적 거리가 인정되어 한우가 Bos taurus 및 Bos indicus 품종들의 교잡에 의해 형성되지 않았음을 확인할 수 있었으며, 또한 동북아시아 소 품종들은 지역적 별개의 가축화 기원의 가능성이 있음을 제기한다.

Abstract

For the genetic assessment of the cattle breeds including Hanwoo, eleven microsatellite markers on ten bovine autosomes were genetically characterized for 618 individuals of nineteen cattle breeds; North Eastern Asian breeds (Korean cattle, Korean Black cattle, Japanese Black cattle, Japanese Brown cattle, Yanbian cattle), Chinese yellow cattle (Luxi cattle, Nanyang cattle), European Bos taurus (Angus, Hereford, Charolais, Holstein, Limousin), African Bos taurus (N'Dama, Baoule), African Bos indicus (Kavirondo Zebu, White Fulani), Asian Bos indicus (Sahiwal, Nelore) and one Bali cattle, Bos banteng as an outbreed-reference population. Allele frequencies derived from the genotyping data were used in estimating heterozygosities, gene diversities and genetic distances. The microsatellite loci were highly polymorphic, with a total of 162 different alleles observed across all loci. Variability in allele numbers and frequencies was observed among the breeds. The average expected heterozygosity of North Eastern Asian breeds was higher than those of European and African taurines, but lower than those of Asian and African indicines. Genetic distances were estimated using Nei's DA genetic distance and the resultant DA matrix was used in the construction of the phylogenetic trees. The genetic distances between North Eastern Asian cattle breeds and Bos indicus were similar with those between European Bos taurus and Bos indicus, and African Bos taurus and Bos indicus, respectively. The clusters were clearly classified into North Eastern Asian, European and African taurines groups as well as different cluster with Chinese mainland breeds, firstly out-grouping with Bos indicus. These results suggest that Korean cattle, Hanwoo, had not been originated from a crossbred between Bos primigenius in Europe and Bos indicus in India and North Eastern Asian Bos taurus may be have separate domestication from European and African Bos taurus.

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