본문 바로가기
KERD
논문KCI 등재

한국인과 일본인에서 1번 염색체에 부착되는 microsatellite marker의 특징

Characterization of microsatellite markers covering chromosome 1 in the Korean and Japanese populations

박수병|이유진
대한치과교정학회 (The Korean Association Of Orthodontists)|2004.12|대한치과교정학회지 (The Korean Journal of Orthodontics)|제34권 제6호|pp. 537-543

2

조회

0

다운로드

0

인용

0

참고문헌

키워드

Korean한국인일본인JapaneseMicrosatellite markers1번 염색체Chromosome 1)
주제분류치의학

초록

Microsatellite marker는 유전연관분석을 위한 매우 유용한 유전표지이다. 그러나 대부분의 marker들은 서양인의 정보를 이용하고 있으므로 다른 종족에서 사용할 때는 종족간에 존재할 수 있는 유전 변이의 현저한 차이를 검증해야 한다. 한국인과 일본인 집단에서 종족간 유전 변이를 조사하기 위하여, 각각 96명의 비 혈연관계의 한국인과 일본인 개체들에서 DNA를 채취하였다. 그리고 microsatellite set(ABI PRISM Linkage Mapping Set-HD5, Applied Biosystems, Foster City, CA, USA)을 이용하여 1번 인간 염색체 전 부위에 걸쳐 51개의 microsatellite marker들을 배열하고 부착된 marker들의 위치를 분석하여 대립유전자 빈도와 이형질성을 결정하였다. 그 결과, 한국인과 서양인 집단 사이에는 현저한 차이를 보였으나 한국인과 일본인 집단 사이에서는 매우 유사하였다. 본 연구의 결과는 유전 연관 연구에 앞서 일반적으로 상용되는 microsatellite marker에 관한 광범위한 검증을 반드시 시행하여야 한다는 것을 나타낸다. 또한 한국인과 일본인 집단 사이에서 유사하게 나타난 대립유전자 빈도와 이형질성은 두 민족간의 동질성이 높다는 것을 의미하므로 두 민족을 대상으로 한 1번 인간염색체와 관련된 유전 질환의 유전 연관 연구를 시행할 때 동일한 microsatellite marker의 이용 가능성을 제시하였다.

Abstract

Microsatellite markers are considered to be very promising genetic markers for genetic linkage analysis. The majority of the markers are as informative as in Caucasians but there are significant ethnic differences in the genetic variations. In order to investigate the genetic variations in the Korean and Japanese populations and their ethnic differences, 51 microsatellite marker loci spanning the whole human chromosome 1 were arranged from a commercially available set (ABI PRISM Linkage Mapping Set-HD5, Applied Biosystems, Foster City, CA, USA), and then determined the allelic frequencies and heterozygosities for these marker loci in the 96 unrelated Korean subjects and 96 unrelated Japanese subjects. Of all 51 markers tested, significant differences were observed when microsatellite allele frequency pattern of Korean was compared with those of Caucasian, while this pattern was highly similar between Korean and Japanese populations. Our data indicate that an extensive verification of public microsatellite markers in a particular population study should be undertaken prior to their linkage studies. Moreover, this information should facilitate genetic linkage studies of various hereditary diseases, especially in the Koreans and Japanese.

참고문헌 (29)

  1. "Integrated human genome-wide maps constructed using the CEPH reference panel", 6, pp.391~3 (1994)
  2. "A comprehensive genetic linkage map of the human genome", 258, pp.67~86 (1992)
  3. "A second-generation linkage map of the human genome", 359, pp.794~801 (1992)
  4. "A hypervariable microsatellite revealed by in vitro amplification of a dinucleotide repeat within the cardiac muscle actin gene", 44, pp.397~401 (1989)
  5. "Abundant class of human DNA polymorphisms which can be typed using the polymerase chain reaction", 44, pp.388~96 (1989)
  6. "A genome-wide linkage analysis investigating the determinants of blood pressure in whites and African Americans", 16, pp.151~153 (2003)
  7. "Genetics of essential hypertension", 94, pp.77~84 (1993)
  8. "A locus on the long arm of chromosome 1 as a possible cause of essential hypertension", 18, pp.363~6 (1991)
  9. "Mapping genes influencing type 2 diabetes risk and BMI in Japanese subjects", 52, pp.209~213 (2003)
  10. "Screening the genome for rheumatoid arthritis susceptibility genes a replication study and combined analysis of 512 multicase families", 48, pp.906~916 (2003)
  11. "Localized aggressive periodontitis is linked to human chromosome 1q25", 114, pp.291~297 (2004)
  12. "Morphologic determinants in the etiology of class III malocclusions:a review", 12, pp.382~405 (1999)
  13. "A survey of handicapping dentofacial anomalies among Chinese in Hong Kong", 14, pp.505~19 (1964)
  14. "Prevalence of class I in an urban population", pp.947~53
  15. "Prevalence of class I in an urban population", pp.947~53
  16. "Identification of susceptibility loci for mandibular prognathism in genome-wide scan", 58 (2003)
  17. "Chromosome-specific microsatellite sets for fluorescence-based", pp.390~5
  18. "Fluorescence-based resource for semiautomated genomic analyses using microsatellite markers", pp.361~5
  19. "Sets of short tandem repeat polymorphisms for efficient linkage screening of the human genome", 4, pp.449~452 (1995)
  20. "Improved set of short-tandem-repeat polymorphisms for screening the human genome", 60, pp.459~460 (1997)
  21. "Heterozygosities and allelic frequencies of 358 dinucleotiderepeat marker loci in the Japanese population", 43, pp.165~168 (1998)
  22. "A comprehensive genetic map of the human genome based on 5,264 microsatellites", 380, pp.152~154 (1996)
  23. "Origin of the Koreans:a population genetic study", 88, pp.27~36 (1992)
  24. "Evolutionary relationships of human populations on a global scale", 10, pp.927~43 (1993)
  25. "Y-specific DNA polymorphisms of the YAP element and the locus DYS19 in the Korean population", 43, pp.195~198 (1998)
  26. "Y chromosomal DNA variation and the peopling of Japan", 56, pp.951~962 (1995)
  27. "Verification of 525 coding SNPs in 179 hypertension candidate genes in the Japanese population:identification of 159 SNPs in 93 genes", 47, pp.387~394 (2002)
  28. "Characterization of 458 single nucleotide polymorphisms of disease candidate genes in the Korean population", 48, pp.213~216 (2003)
  29. "Establishment of an optimized set of 406 microsatellite markers covering the whole genome for the Japanese population", 46, pp.207~210 (2001)

관련 논문AI추천

Population Genetics of 23 Y-Chromosomal STR Loci in South Koreans권정아, 김남수, 박명진, 박지환, 유승연, 조남수, 한송이, 황정희한국과학수사학회 · 과학수사학회지2014 · 제8권 제1호한국인에서의 Y 하플로그룹의 분포 양상 및 다른 민족과의 비교김기하, 김홍현, 류성희, 서승범, 이숭덕, 이재원, 이혜영, 이효정, 장애화, 조소희대한법의학회 · 대한법의학회지2012 · 제36권 제1호STR 마커를 이용한 한국인에서의 혈연관계 판정기준 분석김종식, 박수정, 이숭덕, 이승환, 이재원, 이효정, 정수진한국과학수사학회 · 과학수사학회지2016 · 제10권 제2호한국인에서 HLA유전자 부위 내 microsatellite 표지자의 분포와 HLA 대립유전자의 유전적 연관성김춘추, 김태규, 김희제, 민우성, 윤호열, 이종욱, 장정필, 조병식, 최은정, 최희백대한면역학회 · Immune Network2007 · 제7권 제3호DNA 형별검사에 의한 한국인의 HLA-A, -B, -DR 형별 및 일배체형의 분포김선미, 김현수, 노은연, 박명희, 임영미, 한복연대한진단검사의학회 · Annals of Laboratory Medicine2003 · 제23권 제6호초위성체 표지를 이용한 한국재래돼지 집단의 분자유전학적 고찰고응규, 손준규, 연성흠, 위미순, 유용희, 이승수, 이풍연, 조창연, 진현주한국축산학회 · 한국축산학회지2011 · 제53권 제1호

이 간행물의 다른 논문 (8건)

한국인 정상교합자의 치아크기와 치열궁 계측치에 관한 연구김태우, 장영일, 문성철, 이신재, 남동석pp. 473-480한국인 정상교합자의 하악 치열궁 형태모성서, 김정기, 차경석, 태기출, 국윤아, 윤영국, 김성훈pp. 481-487치아 크기와 치열궁 폭경이 치아밀집에 미치는 영향김정태, 조진형, 백형선, 황현식pp. 488-496제II급 2류 부정교합에서 하악 절치 치축의 장기적인 안정성에 관한 연구김태우, 최원철pp. 497-505하치조 신경 절단이 치주인대공간에서 파골세포에 미치는 영향박경덕, 배용철, 경희문, 성재현pp. 506-513
원문 보기