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PCR-RFLP를 이용한 한우 Stearoyl-CoA Desaturase-1(SCD1)유전자의 SNP 및 경제형질 관련성 분석

Association Between a SNP of Stearoyl-CoA Desaturase-1 (SCD1) Gene and Economic Traits using PCR-RFLP in Hanwoo

김진우|이성진|이승규|이영섭|김훈|김기범|최정우|오재돈|송영한|이학교|홍민욱|박새롬
동물생명과학연구소 (Institute of Animal Life Science)|2012.06|동물자원연구 (ANNALS OF ANIMAL RESOURCE SCIENCES)|제23권 제1호|pp. 1-7

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SNPHanwooPCR-RFLPSCD1 gene
주제분류축산학

초록

본 연구는 한우의 경제형질에 영향을 미치는 유전자를 개발하여 마커도움선발(marker assisted selection; MAS)로써의 사용을 목적으로 간과 근육지방의 지방축척에 연관성을보인 유전자인 Stearoyl-CoA Desatyrase(SCD1) 유전자의 다형성을 연구하여 경제형질과의 연관성을 확인하고자 수행하였다. 103두의 한우집단에서 PCR-RFLP방법을 통하여SCD1 유전자의 878T>C SNP를 확인하였으며 CC, CT, 그리고 TT의 세가지 유전자형을 확인하였다. 한우에서 유전자출현빈도는 CC 유전자형이 0.252, CT 유전자형이 0.563 및TT 유전자형은 0.184로 나타났으며 이는 다른 품종에서의연구결과와 유사한 결과를 보여주었다. 경제형질과 SNP의연관성 분석에서 TT 유전자형이 CC 유전자형 보다 도체중(CW)에서 46.71 kg 정도 높은 평균값을 보였고 두 유전자형사이에 유의적인 차이를 나타냈다(p<0.05). 한편 다른 경제형질에서 유의적인 차이가 나타나진 않았으나 등심단면적(LMA)과 등지방두께(BF)에서는 CC 유전자형이, 근내지방도(MS)에서는 CT 유전자형이 높은 평균값은 나타내었다. 본 결과에 대해 마커 도움선발로 사용되기 위해서는 추후지속적인 연구가 요구되어지며, SCD1 유전자의 878T>C SNP은 한우의 도체형질을 위한 유전자 마커로서 활용 가능할 수 있을 것으로 사료되어진다.

Abstract

Stearoyl-CoA desaturase (SCD1) gene plays important role in fatty acid composition. In order to find marker-assisted selection (MAS) for improving the economic trait, this study was performed to identify the 878T>C single nucleotide polymorphism (SNP) on SCD1 gene. Three genotypes (CC, CT, and TT) were detected in 878T>C SNP of SCD1 gene from 103 Hanwoo population by polymorphism chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) and economic traits were analyzed by general linear model. The frequency of allele C and T was 0.534 and 0.466, also the genotype frequency of CC, CT and TT was 0.252, 0.563, and 0.184, respectively in the Hanwoo population. The TT genotype of SCD1 gene showed a significantly higher measures (p<0.05) of carcass weight (CW) than CT, CC genotype. No significant association was detected between genotype and other economic trait (marbling, backfat thickness, and longissimus muscle area) in this study. The results revealed that SCD1 gene 878T>C SNP could be useful for effective MAS to increase the economic quality in Hanwoo population.

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