한우 DECR1 유전자내 SNP 탐색 및 경제형질간의 연관성 분석
Association Study Between the SNP of DECR1 Gene and Economic Traits in Hanwoo
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초록
소의 14번 염색체에 위치한 2,4-Dienoyl CoA reductase1(DECR1) 유전자는 polyunsaturated fattyenoyl-CoA의 β-oxidation과 연관된 호르몬으로 지질대사조절에 영향을 미치는 유전자로 알려져 있다. 따라서 본 연구는 한우의 경제형질 관련 DNA 마커 개발을 목적으로 DECR1 유전자 내의 singlenucleotide polymorphisms(SNPs)를 탐색하고, 경제형질간의 연관성을 분석하고자 수행하였다. 먼저 부모가 서로 다른 한우 종모우에서 DECR1 유전자 내의 SNP를 탐색한 결과 총 13개의 SNPs를 확인하였고, 이 중 G20788A는 valine(Val)에서 methionine(Met)으로, A23262G는 isoleucine(Ile)에서valine(Val)으로 바뀌는 missense mutation으로 확인되었다. 그리고 도체 성적을 보유한 200두의 한우를 대상으로 missense mutation으로 확인된 G20788A와 A23262G의 유전자형과 경제형질간의 연관성을분석하였다. 그 결과 G20788A는 근내지방도와 도체중에서 A23262G는 등지방두께, 배최장근단면적, 근내지방도와 도체중에서 통계적 유의성을 확인 할 수 있었고(P<0.05), 이를 통해 missence mutation인G20788A와 A23262G는 각 경제형질에 영향을 미치는 것을 알 수 있었다. 따라서 본 연구에서 탐색된한우 DECR1 유전자의 SNP 유전자형은 한우 선발 및 개량을 위한 DNA 마커로 활용 가능할 것으로 기대된다.
Abstract
2,4-Dienoyl CoA reductase1(DECR1) gene is a nuclear encoded mitochondrial enzymeinvolved in β-oxidation. The gene encoding DECR1 gene is located on bovine chromosome 14. The objective of this study was to identify single nucleotide polymorphisms(SNPs) in theHanwoo. DECR1 gene to detect SNP affecting economically important traits. 13 SNPs wereidentified in Hanwoo. G20788A changes amino acid from valine to methionine, and A23262Gchanges amino acid from isoleucine to valine. A SNP at G20788A significantly influenced themarbling score(MS) and carcass weigh(CW), and A23262G significantly affected the backfatthickness(BF), Longissimus Muscle Area(LMA), MS and CW. The results suggest that DECR1polymorphisms might be an important genetic influence on economic traits in Hanwoo.
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