성범죄 증거물에서 Y-STR Genotyping을 위한 PowerPlex®Y23 Kit의 법과학적 적용 가능성 검토
A Validation Study to Apply of PowerPlex®Y23 Kit in Y-STR Genotyping of Sexual Assault Samples.
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초록
성범죄에 있어 남성의 흔적을 찾기 위한 Y-STR형 분석은 다량의 여성 DNA가 오염된 시료에서 큰 의미가 있다. 최근, 출시된 PowerPlex®Y23 kit (PPY23 kit)와 기존에 사용되었던 AmpFLSTR®Y-filerTM kit (Y-filer kit)의 민감도와 검출한계를 비교하고 두 제품과의 민감도 비교를 위하여 AmpFLSTR®Identifiler PLUS kit (ID PLUS kit)를 추가하 였다. 순차적으로 희석된 시료들을 이용하여 각 kit에서 전체 유전자형이 안정적으로 확인되는 DNA 시료의 최소량을 비교한 결과, ID PLUS kit와 Y-filer kit는 0.063 ng 그리고 PPY23 kit는 0.031 ng에서 안정적인 유전자형을 확인할 수 있는 민감성을 보였다. 다량의 여성 DNA에 미량의 남성 DNA가 혼합된 경우, 남성 특이적인 Y-STR 유전자형을 확보할 수 있는 최대 비율(남성 DNA:여성 DNA)을 확인해 보았다. 그 결과, Y-filer kit는, 1:2,000 혹은 1:4,000까지 남성의 유전자형을 안정적으로 확인할 수 있는 반면에 PPY23 kit는 그 보다 더 높은 비율인 1:20,000 배까지 안정적으로 남성의 유전자형을 확보할 수 있었다. PPY23 kit의 이러한 높은 민감도는 미량의 남성 DNA에 다량의 여성의 DNA가 혼합된 여성의 팬티나 질 내용물과 같은 현장증거물에서도 동일하게 확인되었다. 그러나, 두 남성의 DNA가 서로 혼합된 경우에는 PPY23 kit와 Y-filer kit 사이에서 민감성의 차이를 확인할 수 없었다. 이러한 결과들은 현장 증거물에서 PPY23 kit가 Y-filer kit를 충분히 대체할 수 있을 뿐 아니라, 미량의 DNA 시료에 대해 유용성이 높아 적용이 유용할 것으로 사료된다.
Abstract
Herein, we evaluated the sensitivity and efficiency of PowerPlex®Y23 kit (PPY23 kit) in Y-STR DNA profiling by comparing the other commonly used AmpFLSTR®Y-filerTM kit (Y-filer kit). To determine the sensitivity, Amp FLSTR® Identifiler PLUS kit (ID PLUS kit) was additionally compared with two kits. In serial dilutions of single source DNA samples, full profiles using Y-filer kit and ID PLUS kit were obtained with 62.5 pg of DNA. Although PPY23 kit includes more loci than Y-filer kit and ID PLUS kit, its full and correct profile was detected with 31 pg of DNA, establishing the PPY23 kit as a sensitive method for STR testing. In male:female DNA mixtures of varying ratios, Y-filer kit generated the complete DNA profiles at 1:4,000 ratio. Under the same conditions, PPY23 kit produced the full DNA profiles at 1:20,000 ratio, suggesting the PPY23 kit as an effective kit for Y-STR profiling of male:female mixtures. Holding the input amounts of 1 ng total DNA, mixtures of two male DNA samples were examined at various ratios. All three kits produced the full DNA profiles at 1:3 and 3:1 ratios. These results suggest that PPY23 kit is more useful than Y-filer kit for Y-STR DNA profiling, especially inmale:female DNA mixtures.
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