신속 DNA 분석기를 이용한 매트릭스(간섭 물질) 기반 대조 시료의 검출률 비교
A Comparison of Control Sample Detection Rates Based on Matrix (Interfering Substances) using On-Site Rapid DNA Analyzer
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초록
본 연구에서는 신속 DNA 분석기의 DNA 농도에 따른 STR (Short Tandem Repeat) 프로필 생성 결과를 분석하여 검출한계를 추정하고, 구강세포 채취 및 DNA 분석 과정에서 방해물질이 STR 프로필 생성에 미치는 영향을 평가하였다. 이를 위해 표준 DNA 시료를 다양한 농도로 준비하여 신속 DNA 분석기를 이용해 분석한 후 검출한계를 비교하였다. 또한 방해물질 치약 커피 및 알코올 이 포함된 구강세포를 면봉으로 채취한 후, 추출 정제 과정을 거친 시료와 정제 과정을 거치지 않은 시료를 각각 분석하여 방해물질이 분석 결과에 미치는 영향을 검토하였다. 그 결과 신속 DNA 분석기에 적정한 DNA 농도를 ,확인하였으며(5~250 ng), 구강세포 채취 시 특정 방해물질이 존재할 경우, STR 프로필 생성이 저해됨을 확인하였다. 본 결과는 신속 DNA분석기의 신뢰성을 평가하고 정밀 DNA 분석과의 비교 · 검증 과정에서 활용될 수 있을 것으로 기대된다.
Abstract
This study analyzed the effects of DNA concentration on Short Tandem Repeat (STR) profile generation using an on-site rapid DNA analyzer to estimate the limit of detection (LOD) and evaluated the impact of interfering substances during buccal cell collection and DNA analysis. Standard DNA samples at various concentrations were analyzed to determine the LOD. Additionally, buccal cells containing interfering substances (toothpaste, coffee & alcohol) were collected using swabs, and both purified and unpurified samples were analyzed to evaluate their effects on STR profiles. The results identified an optimal DNA concentration for the on-site rapid DNA Analyzer and confirmed that certain interfering substances hinder STR profile generation. These findings contribute to evaluating the reliability of the on-site rapid DNA Analyzer and can be utilized for comparison and validation with high-precision DNA analysis.