댕댕이나무(Lonicera caerulea var. edulis) 국내 잔존 집단의 유전적 다양성
Genetic Diversity of Lonicera caerulea var. edulis in South Korea
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댕댕이나무는 국내 강원도 일부 고산지역과 한라산에 분포하는 희귀종이다. 본 연구에서는 국내 6개 댕댕이나무 자생 집단의 161개체를 대상으로 유전 변이량을 조사하였다. 평균 유전다양성은 0.2535 (S.I.)로 나타났으며, 설악산2 집단(S.I.=0.3518) 이 가장 높은 값을, 계방산 집단(S.I.=0.1047)이 가장 낮은 값을나타냈다. 결과적으로 희귀종에서 보여지는 양상인 낮은 수준의 유전다양성을 나타냈다(Ae=1.25, P=64.6%, S.I.=0.25). AMOVA분석 결과 유전 변이량의 65.31%가 집단 내 개체 간의차이에 기인하며, 34.69%가 집단 간의 차이에 기인하여 집단 간에 높은 유전 분화율을 나타냈다. 이에 특이적으로 낮은 유전 변이량을 나타낸 계방산 집단을 제외하고 AMOVA분석을 수행한결과 81.29%가 집단 내, 18.71%가 집단 간 차이에 기인하는 것으로 나타났다. 유전거리를 바탕으로 수지도 작성결과 지리적거리와 상관이 없었다. 계방산 집단의 유전적 거리는 나머지 다섯 개 집단과는 매우 먼 것으로 확인되었다. 계방산 집단을 제외한 5개 집단 간의 유전적 동질성은 0.95∼0.97로 매우 높은 수준의 동질성을 나타냈다. 댕댕이나무는 자생 집단의 수가 매우 적고, 낮은 수준의 유전변이를 나타내므로 적극적 보전이 필요한것으로 판단된다.
Abstract
Lonicera caerulea var. edulis is a rare species found in some alpine region of Korea. Genetic variation in L. caerulea var. edulis has been investigated by examining 161 individuals from six natural populations: Mt. Seorak 1, Mt. Seorak 2, Mt. Jeombong, Mt. Bangtae, Mt. Gyebang, Mt. Halla. The mean genetic diversity for all the six populations was 0.25 (S.I.). The highest genetic diversity was found in Mt. Seorak (S.I.=0.3158) and the lowest was in Mt. Gyebang (S.I.=0.1047). Comparatively low level of genetic diversity was observed (Ae=1.25, P= 64.6%, S.I.=0.25), which is a typical pattern for rare tree species. AMOVA showed exceptionally large proportion of genetic variations both for among populations (34.69%) and within populations (65.31%). Excluding Mt. Gyebang, the genetic variation among and within population was 18.71% and 81.29% respectively. The UPGMA dendrogram based on genetic distance is not suitable for geographic relationship. Genetic distance of Mt. Gyebang was most distant from the other populations. Excluding Mt. Gyebang, the genetic identities among the five populations were 0.95 to 0.97, which is very high similarity level of genetic identity. This low level of genetic variations and the lack of site in nature indicates that L. caerulea var. edulis demanded a serious conservation.
참고문헌 (35)
- Agnew, A.D.Q, "The ecology of Juncus effusus L. in North Wales", J. Eol, 49, pp.83~102 (1961)
- Avise, J.C, "Molecular Markers, Natural History and Evolution: Natural History and Evolution", pp.8~15 (1994), Springer Sci. Bus
- 최형순, "한라산 시로미(Empetrum nigrum var. japonicum)의 유전적 다양성 및 공간적 유전구조", 한국임학회지, 93(3), pp.175~180 (2004), 한국임학회
- Chu, J.G, "Population Genetics", pp.1~440 (1998), Chung-Ang University Publishing Co
- Excoffier, L, "Analysis of molecular variance infferred from metric distance among DNA haplotypes : Application to human mitochondrial DNA retribution data", Genet. Soc. of America, 131, pp.479~491 (1992)
- Futuyma, Douglas J, "Evolution", pp.518~ (2008), Life science
- 한상돈, "들쭉나무 격리잔존 2개 집단의 유전변이", 한국임학회지, 94(4), pp.209~213 (2005), 한국임학회
- 송정호, "설악산 대청봉 눈잣나무(Pinus pumila (Pall.) Regel) 집단의 유전다양성과 공간적 유전구조", 한국자원식물학회지, 25(4), pp.407~415 (2012), 한국자원식물학회[DOI]
- Jeffreys, A.J, "Spontaneous mutation rates to new length alleles at tandemrepetitive hypervariable loci in human DNA", Nature, 332, pp.278~281 (1988)
- 김상용, "ISSR 자료에 기초한 만리화(물푸레나무과)의 유전적 다양성", 식물분류학회지, 39(1), pp.48~54 (2009), 한국식물분류학회
- Kim, Y.L, "DNA marker analysis and QTL mapping", pp.21~38 (2005), Korea Forest Research Institute
- 공우석, "한반도 고산식물의 구성과 분포", 대한지리학회지, 37(4), pp.357~370 (2002), 대한지리학회
- 공우석, "지구온난화에 취약한 지표식물 선정", 한국기상학회지, 41(2, pp.1) (2005), 263~273[DOI]
- 공우석, "극지·고산식물 월귤의 격리 분포와 기온요인", 대한지리학회지, 43(4), pp.495~510 (2008), 대한지리학회
- 권해연, "I-SSR Variation Within and Among Korean Populations in Taxus cuspidata", 한국임학회지, 91(5), pp.654~660 (2002), 한국임학회
- Lee, B.C, "Korea Red Data Book", pp.138~ (2009), Korea National Aboretum
- 이석우, "Genetic Variation of I-SSR Markers in the Natual Populations of a Rare and Endangered Tree Species, Oplopanax elatus in Korea", 한국임학회지, 91(5), pp.565~573 (2002), 한국임학회
- Lyu, M.I, "Population ecology", pp.236~244 (2002), Seoul National University
- Malodobry, M, "Evaluation of the yield and some components in the fruit of blue honeysuckle (Lonicera caerulea var. edulis Turcz. Freyn.)", Fol. Horticulture, 22, pp.45~50 (2010)
- Milligan, B.G, "Conservation genetics beyond the maintenance of marker diversity", Mol. Ecol, 3, pp.423~435 (1994)
- Nei, M, "Analysis of gene diversity in subdivised populations", Proc. Natl. Akad. Sci. USA, 70, pp.3321~3323 (1973)
- Ochmian, I, "Field performance, fruit chemical composition and firmness under cold storage and simulated “shelf-life” conditions of three blue honeysuckle cultigens (Lonicera caerulea)", Fruit and Ornamental Plant Res, 16, pp.83~91 (2008)
- Plekhanova, M.N, "International Society for horticulture science acta hoticulture. A new commercial crop for temperate climate: Genet. Res. Breeding", Eucarpia symposium on fruit breeding and genetics blue honeysuckle (Lonicera Caerulea), 538, pp.159~164 (1999)
- Jeon, S.H, "Princilpe of genetics", pp.514~574 (2003), Life science
- Schneider, S, "Arlequin : An integrated software package for population genetics data analysis", Evol. Bioinformatics, 1, pp.47~50 (2005)
- Skupień, K, "Influence of ripening time on fruit chemical composition of two blue honeysuckle cultigens", Fruit and Ornamental Plant Res, 17, pp.101~111 (2009)
- Xiao, L.Q, "ISSR variation in the endemic and endangered plant Cycas guizhouensis (Cycadaceae)", Ann. Bot, 94, pp.133~138 (2004)
- 양병훈, "I-SSR 표지자에 의한 눈측백나무 남한 잔존집단의 유전변이와 구조", 한국임학회지, 98(1), pp.1~7 (2009), 한국임학회
- Yeh, F.C, "POPGENE 3.2 : Microsoft Windows-based freeware for population genetic analysis" (1999), University of Alberta
- 윤성일, "Inter Simple Sequence Repeats (ISSR) 표지자를 이용한 한국꿩의 유전적 다양성 및 아종간의 유연관계 분석", 환경생물, 26(2), pp.66~75 (2008), 한국환경생물학회
- Zietkiewicz, E, "Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR) anchored polymerase chain reaction amplification", Genomics, 20, pp.176~183 (1994)
- 지구온난화와 한라산의 식생, "고정군", 제주특별자치도 한라산연구소, 3~17, pp.조사연구보고서 6 (2007)
- 김상식, "원색 한국 수목도감", pp.291~ (1998), 계명사
- 신준환, "보전생물학", pp.1~348 (2000), 사이언스북스
- 이영노, "한국의 고산식물", pp.358~ (2000), 교학사