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논문

제주재래돼지 집단에서 집단특이적 mtDNA haplotype과 유전적 다양성

Genetic Variation and Population-Specific Mitochondrial DNA Haplotype Found in the Jeju Native Pig Population

이상수|조인철|최유림|성필남|오운용|이종언|고서봉|고문석|한상현|강승률|오문유
한국축산학회 (Korean Society of Animal Sciences and Technology)|2004.12|한국축산학회지 (Journal of Animal Science and Technology)|제46권 제6호|pp. 917-924

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주제분류축산학

초록

미토콘드리아 ND2 유전자와 세 가지 tRNA (tRNA-Met, tRNA-Trp, tRNA-Ala)들이 포함하는 mtDNA 절편의 PCR-RFLP haplotyping 기법으로 제주도에서 사육하는 한국 재래돼지를 포함하는 5개 품종에 대한 유전적 다양성을 조사하였다. 몇몇 돼지 품종에서 mtDNA 상의 제한절편길이의 다형성이 관찰되었다. HaeIII-와 HinfI- RFLP에서는 두 가지 제한절편 유형, Tsp509I- RFLP에서는 네 가지 유형으로 각각 구분되었다. 발견된 제한절편 유형들을 조합하여 mtDNA haplotype으로 구분했을 때, 모두 네 가지 haplotype들이 발견되었고 집단에 따라 각기 다른 빈도를 나타내었다. 하나의 동일한 haplotype mtWB가 한반도 야생멧돼지와 Large White 집단에서 관찰되었다. Duroc과 Landrace 품종들은 여러 모계 선조에서 유래되었을 것으로 추정되는 두 가지의 haplotype들을 가지고 있었다. 제주도에서 사육되고 있는 한국재래돼지 집단에서는 mtJD와 mtJN haplotype들이 관찰되었는데, 이 중 mtJN은 빈도가 높고 집단 특이적이었다. 본 연구의 결과는 제주 돼지 집단의 형성에 적어도 둘 이상의 모계 선조가 참여했으며, 이후 동아시아 인근 돼지 품종들과의 인위적인 교잡이 이루어졌을 것으로 추정된다. 연구진의 예상과는 달리 한반도 야생멧돼지가 제주 재래돼지 집단의 모계 선조라는 증거는 확인되지 않았다. MtDNA haplotype과 돼지 계통간의 관계에서의 특이성은 돼지 육종에 있어 모계 확인과 계보 구성에 매우 유용한 정보를 제공할 것으로 사료된다.

Abstract

Using PCR-RFLP haplotyping for the mitochondrial DNA(mtDNA) fragment containing the NADH dehydrogenase 2 gene(ND2) and three tRNA genes(tRNA-Met, tRNA-Trp and tRNA-Ala), we characterized the genetic diversity of five pig breeds including Jeju native pigs. mtDNA polymorphisms showing distinct cleavage patterns were found in the pig breeds. Two digestion patterns were detected when HaeIII- and HinfI-RFLP, and four in the Tsp509I-RFLP analyses. Combining the three restriction enzyme digestion patterns found in five different pig breeds, four mtDNA haplotypes were observed and the haplotype frequencies were significantly different by the pig breeds. A monomorphic haplotype, mtWB, was observed in both Korean wild boars and Large White pigs. Both Duroc and Landrace pigs contained two haplotypes suggesting their multiple maternal lineages. Jeju native pig has two haplotypes(mtJN and mtJD). Of these, mtJN is identified as a Jeju native pig specific haplotype. This study suggested that more than two progenitor populations have been taken part in the domestication process of the Jeju native pig population, and/or probably subsequent crossing with other pig breeds from near east Asia. Unlike with our prediction, there was no direct evidence under molecular levels on the maternal introgression of Korean wild boar in the domestication of Jeju native pigs. In conclusion, specificity of mtDNA haplotypes related to pig breeds will be useful for identifying the maternal lineage as well as constructing the genealogical pedigree in pigs.

참고문헌 (29)

  1. "Mitochondrial DNA sequence variation and phylogenetic relationships among Iberian pigs and other domestic and wild pig populations", 34, pp.319~324 (2003)
  2. "Genome analysis: A laboratory manual.", ge(me analysis) (1997), Cold Spring Harbor Laboratory Press
  3. "Rapid evolution of animal mitocondrial DNA", pp.1967~1971 (1979)
  4. "History of Domestic Mammals in Central and Eastern Europe" (1974)
  5. "Maternal inheritance of human mitochondrial DNA", pp.6715~6719 (1980)
  6. "origin of the domestic pig: independent domestication and subsequent introgression", 154, pp.1785~1791 (2000)
  7. "Polymorphism of the mtDNA cytochrome B and NADH dehydrogenase 6 genes in Tsushima and Jeju native horses", 26, pp.1~7 (2004)
  8. "Mitochondrial genetic variation in Chinese pigs and wild boars", 37, pp.335~343 (1999)
  9. "G Genetic aspects of domestication, common breeds and their origins. In: Ruvinsky, A., Rothschild, M. F.(eds) The genetics of the pig", pp.17~50 (1998)
  10. "Genetic characterization of horse bone excavated from the Kwakji archaeological site", 14, pp.224~230 (2002)
  11. "A phylogenetic study of the domestic pig estimated from the near-complete mtDNA genome", 52, pp.302~308 (2001)
  12. "Phylogenetic relationships of Asian and European pig breeds determined by mitochondrial DNA D-loop sequence polymorphism", 33
  13. "Complete nucleotide sequence of pig(Sus scrofa mitochondrial genome and dating evolutionary divergence within Artiodactyla", 236, pp.107~114 (1999)
  14. "a program for improved detection of transfer RNA genes in genomic sequence", 25, pp.955~964 (1997)
  15. "Phylogenetic relationship of Cheju native horses by mitochondrial DNA analysis", pp.13~20 (1994)
  16. "Genetic relationship amongst the major non-coding regions of mitochondrial DNAs in wild boars and several breeds of domesticated pigs", 32(be), pp.139~147 (2001)
  17. "The complete mitochondrial DNA sequence of the pig", 47, pp.302~306 (1998)
  18. "Polymorphism of mitochondrial DNA in pigs based on restriction endonuclease cleavage patterns", pp.105~113 (1985)
  19. "Prehistoric Sado Island populations of Sus scrofa distinguished from contemporary Japanese wild boar by ancient mitochondrial DNA", 21(be), pp.219~228 (2004)
  20. "Mitochondrial DNA and two perspectives on evolutionary genetics", pp.375~400 (1985)
  21. "Genetic diversity present within the near-complete mtDNA genome of 17 breeds of indigenous Chinese pigs", 94, pp.381~385 (2003)
  22. "제주도 고대 유적지로부터 발굴된 동물 뼈의 mitochondria DNA의 유전 분석" (2003)
  23. "제주 김녕리 궤내기 동굴 유적에서 출토된 뼈유물의 고고학적 연구", 36, pp.757~761 (1996)
  24. "재래 흑돼지와 중국 재래돈간의 Melanocortin Receptor 1 (MC1R)유전자의 유전자형 분석", 43, pp.1~8 (2001)
  25. "제주 종달리 패총", pp.101~108 (1997), 제주대학교박물관
  26. "제주 곽지 패총", pp.252~255 (1997), 제주대학교박물관
  27. "랜드레이스, 대요크셔듀록 및 제주 흑돈의 Melanocortin 1 Receptor(MC1R 유전자의 유전자형 분석", 44, pp.207~212 (2002)
  28. "Single stranded conformation polymorphism 분석에 의한 돼지 Duroc 품종의 미토콘드리아 DNA 유전적 변이", 45, pp.911~916 (2003)
  29. "돼지 Melanocortin Receptor 1(MC1R)대립유전자 3의 신규 유전변이 탐색", 46, pp.1~6

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