Landrace 및 Yorkshire 순종집단의 산자수에 대한 모체유전효과
Maternal Genetic Effects for Litter Size on Landrace and Yorkshire Purebred in A Nucleus Herd
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초록
모계라인 종돈의 산자수 개량을 위한 모돈 선발에 있어서 개체의 상가적 유전효과뿐만 아니라 모체의 유전효과를 고려하는 것이 육종가를 기준으로 종돈을 선발할 때, 종돈선발에 어느 정도 영향하는지를 알아보기 위하여 본 연구를 실시하였다. 본 연구를 실시하기 위하여 이용된 자료는 특정 순종돈 집단에서 1998년부터 2017년 7월까지 수집된 Landrace 2,634두의 10,836 번식기록과, Yorkshire 3,186두의 14,463 번식기록을 이용하였으며 분석에 이용된 형질은 미라를 제외한 총산자수(TNB1), 미라를 포함한 총산자수(TNB2) 및 생존산자수(NBA) 등이었다. 통계분석방법으로써 유전효과에 대한 변이추정은 3개의 형질을 동시에 고려하고 개체의 상가적 유전효과를 고려한 다변량 개체 혼합모형식(Model 1) 및 이들 요인을 모두 포함하고 어미의 상가적 유전효과를 포함하여 설정한 혼합모형식(Model 2)을 설정하여 제한최대우도법으로 이들 요인에 대한 분산성분과 유전모수를 추정하였으며 각각의 모형식으로부터 추정된 분산성분을 이용하여 BLUP방법으로 육종가를 추정하였고 모형식에 따른 각 형질별 개체의 육종가를 비교하였다. 각각의 모형식과 품종별로 유전변이를 추정한 결과, Model 2에서 고려된 모든 형질에 있어서 전체 변이의 약 10%내외가 개체의 상가적 유전변이에서 기인되며 약 1~2%의 크기로 모체 유전효과의 의한 변이가 존재하는 것으로 추정되었다. 또한 상가적 유전변이와 모체 유전변이 간에는 중도의 정의상관 또는 부의상관을 갖는 것으로 추정되었다. 각 형질별 모형식간에 추정된 육종가 추정치를 비교한 결과, Model 1으로부터 개체의 상가적 유전효과에 의한 육종가 추정치와 Model 2로부터 개체의 상가적 유전효과 및 모체유전효과를 모두 고려한 총 육종가 추정치간에 개체별 유전적 능력순위가 0.92이상의 높은 상관을 갖는 것으로 추정되어 모형식간에 개체의 유전능력 순위에 커다란 차이가 없는 것을 알 수 있었다. 따라서 산자수 개량을 위한 종돈선발을 추정 육종가에 기초하여 선발하고자 할 때, 모체의 유전효과를 고려하지 않고 육종가를 추정하여선발을 실시하여도 종돈선발의 정확도에 크게 영향하지 않을 것으로 사료되었다.
Abstract
This study was conducted to find out that how much does it effects as it considered not only animal additive genetic effect but also maternal genetic effect for improving litter traits of pigs. The data of 10,836 records on 2,636 sows in Landrace and 14,463 records on sows in Yorkshire were analyzed which had been measured from 1998 to July 2017 in a nucleus herd of pig population. The traits used on this analysis were total number of born with (TNB2) and without mummy (TNB1) and number of born alive (NBA). Two different multivariate animal mixed models were considered and compared of variance components estimated from these models. The one (Model 1) was set up with assumed to parity, return events and batch effects as fixed and service sire, permanent environment and animal additive genetic effects as random. The other (Model 2) was same with Model 1 except considering maternal additive genetic effects as random. (Co)variance for random effects and genetic parameters were estimated using restricted maximum likelihood method and breeding values as best linear unbiased prediction were estimated using preconditioned conjugate gradient algorithm on each model and breed. From these models, heritability estimates for NBA were about 0.10 and 0.11 on both models in Landrace and Yorkshire, respectively. Forthermore, it was estimated that there were little variations in the maternal genetic effects with roughly 1~2% of total variation. Result from comparing estimated breeding values for each trait between each model, ranking of genetic capability through total breeding values on model 1 and on model 2 showed highly correlated with more than 0.92. Consequently, for improving litter traits, selection based on breeding values by direct genetic effects without considering maternal genetic effects were reccommendable.
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