전통의학 지식을 활용한 한약재 네트워크 분석 시스템의 확장
Expanding K-herb Network Analysis System by Exploiting Traditional Medical Knowledge
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초록
생물의학 분야에서 화합물, 단백질/유전체, 질병에 대한 상호작용 및 연관관계에 대한 심층 분석을 위한 다양한 방법들이 연구되고 있다. 본 연구에 앞서, 우리는 PubMed 논문을 기반으로 한약재와 관련된 화합물, 단백질/유전체, 질병에 대한 네트워크를 구축하고 다차원 분석 도구를 개발하였다. 그러나 기 개발된 시스템은 한약재에 대한 다양하고 체계적인 전통의학 지식의 네트워크 구축 및 분석 기능이 결여되어 있다. 이에 본 논문에서는 전통의학 정보 연계를 통한 한약재 네트워크 다차원 분석 시스템을 확장하였다. 이를 위해서 PubMed 논문 기반 한약재 네트워크 시스템의 네트워크 구축 및 User Interface를 파악하고 전통의학 정보포털인 오아시스 한약재 관련 DB 스키마를 분석하여 동기화가 가능한 좌우 두 개의 뷰로 설계하였다. 좌측의 전통의학 지식 기반 한약재 네트워크 다차원 분석 시스템에는 한약재, 한약처방, 효능, 주치 데이터를 이용하여 네트워크를 구축하고 다차원 분석이 가능하게끔 개발하였으며 오아시스의 논문, 처방, 모노그래프 및 표본에 대한 링크를 제공할 수 있도록 개발하였다. 확장된 한약재 네트워크 다차원 분석 시스템은 한의약 및 생물의학 분야의 관련 연구자에게 유용한 네트워크 분석도구로써의 역할을 기대할 수 있을 것이다.
Abstract
In biomedical research area, various researches have been carried out to develop novel tools for analyzing biomedical interactions and relationships between compounds, proteins, genes, and diseases. In previous project, we built network of biomedical information related to herbal medicine and developed multidimensional analysis tools exploiting those relationship between data. However the previous system is not capable of building network of traditional medical knowledge of herbal medicine and analyzing it. In this paper, therefore, we aimed to expand the previous system by adopting traditional Korean medical knowledge. In order to design the expanded system, we analyzed the process of building network and user interfaces of the previous system as well as the database schema related to herbal medicine in traditional Korean medicine information portal (OASIS). The expanded system has two sided view of network. In the left side of view, there is traditional medical knowledge based network which is composed of herbal medicine, herbal prescription, efficacy, and target and provides links to the web contents of papers, prescriptions, monographs, and specimen of OASIS. The expanded K-herb network multidimensional analysis system by connecting traditional medical knowledge will be a useful network analysis tool to researchers in the traditional medical and biomedical area.
참고문헌 (15)
- C. A. Ouzounis, "Early bioinformatics: the birth of a discipline—a personal view", Bioinformatics, 19(17), pp.2176~2190 (2003)
- 서동민, "바이오 패스웨이 다차원 분석 시스템 개발", 한국콘텐츠학회 논문지, 14(11), pp.467~475 (2014), 한국콘텐츠학회[DOI]
- 서동민, "PubMed 문헌 분석을 통한 한약재 네트워크 다차원 분석 시스템 개발", 한국콘텐츠학회 논문지, 16(6), pp.260~269 (2016), 한국콘텐츠학회[DOI]
- A. L. Hopkins, "Network pharmacology: the next paradigm in drug discovery", Nature Chemical Biology, 4, pp.682~690 (2008)
- B. D. Strooper, "The cellular phase of alzheimer’s disease", Cell, 164(4), pp.603~615 (2016)
- A. L. Barabasi, "Network medicine-From obesity to the “diseasome”", The New England Journal of Medicine, 357, pp.404~407 (2007)
- 진훈, "서양 문헌정보를 이용한 중풍 관련 한의학 변증에 대한 정보학적 분석", 정보과학회논문지 : 소프트웨어 및 응용, 40(2), pp.81~89 (2013), 한국정보과학회
- 예상준, "한의학 통계자료를 이용한 지식정보 데이터베이스 구축 연구", 대한한의학회지, 34(1), pp.170~178 (2013), 대한한의학회
- 정윤경, "네트워크 분석을 이용한 『景岳全書』 新方八陣의 탐색적 구조 분석", 대한한의학회지, 35(3), pp.49~59 (2014), 대한한의학회
- 이정현, "본초 상호작용 관계망 분석 및 활용 방향", 대한예방한의학회지, 17(1), pp.1~11 (2013), 대한예방한의학회
- 김안나, "네트워크 분석을 통한 천식 치료 처방의 본초 조합 연구", 한국지식정보기술학회 논문지, 11(5), pp.537~548 (2016), 한국지식정보기술학회
- A-R. Lee, "Reduced allergic lung inflammation by root extracts from two species of peucedanum through inhibition of Th2 cell activation", Journal of Ethnopharmacology, 196, pp.75~83 (2017)
- S-J. Yea, "A framework for the targeted selection of herbs with similar efficacy by exploiting drug repositioning technique and curated biomedical knowledge", Journal of Ethnopharmacology, 208, pp.117~128 (2017)
- "OASIS" (2018)[URL]
- "K-herb Network Multidimensional Analysis System" (2018)[URL]