사례연구: 포르말린 고정 탯줄 조직의 STR 분석: 고정 방법 및 수세 조건의 영향 평가
Case Study : STR Analysis of Formalin-Fixed Umbilical Cord Tissue: Evaluation of the Effects of Fixation Method and Washing Conditions
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초록
본 연구에서는 약 3개월간 4% 중성 포르말린(formalin)에 고정된 탯줄 조직과 동일 조직으로부터 제작된 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 시료를 대상으로 STR (Short Tandem Repeat) 분석을 수행하 고, 고정 방식 및 전처리 조건이 분석 효율에 미치는 영향을 비교하였다. 포르말린 고정 조직은 수세 기간 을 24시간, 10일, 20일로 달리하여 전처리하였고, FFPE 시료는 자일렌(xylene) 기반 탈파라핀 처리를 적 용하였다. 분석 결과, FFPE 시료에서는 모든 STR 좌위에서 안정적인 프로필과 높은 DNA 농도가 확보된 반면, 포르말린 고정 조직은 20일 수세 조건에서만 일부 STR 프로필이 확인되었고 짧은 수세 조건에서는 DNA가 검출되지 않았다. 이는 파라핀 포매 처리가 포르말린 유래 손상을 효과적으로 억제하여 STR 분석 효율을 유지하는 데 유리함을 보여준다. 본 연구는 병리조직 기반 STR 분석에서 FFPE 시료의 활용 가능성과 전처리 표준화의 필요성을 시사하며, 감정 실무 적용을 위한 기초자료를 제공한다.
Abstract
This study conducted STR (Short Tandem Repeat) analysis using umbilical cord tissue that had been fixed in 4% neutral buffered formalin for approximately three months and compared the analytical efficiency with that of formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) samples prepared from the same tissue. The formalin-fixed tissues were pretreated by washing for 24 hours, 10 days, or 20 days, while the FFPE samples underwent xylene-based deparaffinization. The results showed that the FFPE samples yielded stable STR profiles across all loci and exhibited high DNA concentrations, whereas the formalin-fixed tissues showed limited STR profiles only after 20 days of washing, and DNA was not detected under shorter washing conditions. These findings demonstrate that paraffin embedding effectively suppresses formalin-induced DNA damage and helps maintain the efficiency of STR analysis. This study highlights the applicability of FFPE samples in STR analysis of pathological tissues and underscores the need for standardized pretreatment protocols, providing foundational data for practical use in forensic casework.