생물 정보원에 대한 통합 접근을 위한 랩퍼 모델
A Wrapper Model for Integrated Access to Biological Information Sources
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초록
이질의 생물 정보원을 통합하기 위해서는 각 정보원의 이질적인 내용을 숨기고 하나의 관점으로 표현하는 뷰를 정의해야 한다. 본 논문은 생물 정보원 통합 미들웨어를 설계함에 있어서 XML 기반의 뷰 정의모델을 제시하고 그 동작 원리를 보인다. 제시된 모델은 통합시스템 구축을 위한 융통성을 증대시키고, 보다 추상화된 수준에서 통합 질의를 수행할 수 있도록 하기 위하여 사용자 정의 XML 뷰를 지원한다. 제시된 뷰 정의 모델을 기반으로 관계형 데이터베이스와 웹 자원에 대한 랩핑 모델을 제시하고, 아울러 응용 프로그램에 대해서도 같은 모델을 사용한 랩핑 결과를 제시한다.
Abstract
In order to integrate heterogeneous biological information sources, it is necessary to define the view that represents unified viewpoint for the multiple sources by hiding heterogeneity of the data. We present an XML-based view definition model and show its operating principles in designing the middleware system to integrate biological information sources. This model supports the user-defined XML view to increase flexibility in constructing the integration system and execute integrated queries on higher level abstraction. Based on the view-definition model, we present a wrapping model for relational database systems and web resources as well as an application program.
참고문헌 (18)
- Thomas Hernandez, "Integration of Biological Sources：Current Systems and Challenges AheadASU CSE TR-03-005", pp.pp.3-~5 (2003)
- B. Eckman, "Optimized Seamless Integration of Biomolecular Data", pp.1~3 (2001)
- D. Benson, "GenBank", 31(1) (2003)
- "Practical Data Integration in Biopharmaceutical R&D：Strategies and Technologies", pp.9~12 (2002), 3rd Millennium Inc
- L. M. Haas, "DiscoveryLink：A System for Integrated Access to Life Sciences Data Sources", 40(2), pp.5~9 (2001)
- I. A. Chen, "An Overview of the Object-Protocol Model", 20(5), pp.5~10 (1995)
- . Available：http:, , www.ncbi.nlm.nih. gov, pp.2003.[DOI]
- A. S. Kosky, "Exploring Heterogeneous Biological Databases：Tools and Application", pp.pp.3~-5 (1998)
- T. Topaloglou, "Seamless Integration of Biological Applications within Database Framework", pp.5-(6), pp.272~281 (1999)
- Zoe Lacroix, "Biological Data Integration：Wrapping Data^Tools^", 6(2), pp.2~4 (2002)
- .Available, , 2003., ~
- Ian H. Witten, "Data Mining：Practical Machine Learning Tools and Techniques with Java Implementations", pp.265~271 (2000)
- .A, , 2001., ~
- World-Wide Web Consortium, "XML Schema Part 1：Structures" (2001)
- World-Wide Web Consortium, "XML Schema Part 2：Datatypes" (2001)
- World-Wide Web Consortium, "XQuery 1.0：An XMl Query Language" (2003)
- 정채영, "관계형 데이터베이스에서 XML 뷰 기반의 질의 처리 모델", 제10-D권(제2호^), pp.221~232 (2003)
- 정채영, "사용자 정의 뷰 기반의 XML 스키마 관리 시스템", 제10-D권(제3호), pp.367~374 (2003)