한국재래돼지 브랜드 돈유 원산지 검증을 위한 유전자 감식기법 활용 연구
Application of DNA Test for Individual Traceability in the Brand Marking of Korean Native Pig.
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참고문헌
초록
가축의 개체식별은 일반적으로 암호화된 코드를 부여한 이 표를 활용하고 있으며 또한 생체에서 친자확인 검증을 위해 개체 혈액형 등이 활용되어 왔다. 그러나 생체 상태에서의 완벽한 개체 확인을 위한 수단으로 최근 유전자감식 기법이 널리 활용되고 있다. 이때 사용되는 유전자 표지는 재래 돼지의 품종에 따라 매우 다양하게 발현되어 개체 확인 정확도를 높이기 위해 재래 돼지 집단에서 대상 유전자 표지의 유전자형 발현 양상을 분석하여 최적의 표지 유전자 표지를 설정하는 것이 필요하다. 따라서 본 연구는 재래 돼지의 원산지 추적 및 개체식별 검증 시스템에서 절절히 사용할 수 있도록 생체 유전자 감식법에 소요되는 유전자 표지(genetic marker)를 선정하고 이들 유전자 표지의 활용 가능성 모색을 위해 수행되었다. 공시재료로는 후보 유전자 표지의 광범위한 재래 돼지 집단 발현특성의 분석을 위해 재래 돼지 32두(축산연구소 보유)를 활용하였으며 도축되기 전 단계의 생축에서 분석된 유전자형과 도축 후 유통과정에서 분석된 유전자형을 이용한 개체 확인 여부의 검증을 위해 국내 돼지 농가로부터 출하된 20두를 분석에 공시하였다. 후보 유전자 표지는 돼지 유전체(Genome) 확인되어 보고된 18종의 초위성체 DNA(Microsatellite : MS)의 염기서열 정보를 이용하였다. 재래 돼지집단에서 나타난 각각의 대상 유전자 표지의 유전자형 분석결과를 보면 대립유전자는 최소 3개에서 최대 6개였으며 이형접합체 발현율은 0.44～0.69였다. 유효대립유전자수는 각각의 대상 유전자마다 2～4의 범위를 보였으며 이들 중 6개의 유전자 표지를 설정하여 개체 확인을 실시할 경우 매우 높은 정확도(p>0.01)가 나타난 것으로 추정되었다.
Abstract
Identification of animals has been used with an ear tag with dummy code and blood typing has been used for paternity and individual identification in live animals. Various genetic markers are different for breeds of pig and hence, it is necessary to identity the discrete genetic marker in korean native pig. A total of 240 pigs were used to find korean native pig population specific markers that expressed in population of korean native pigs. To identify the individual traceability, 20 animals were randomly chosen and tested for a whole process from being live to slaughter stages. The candidate genetic marker used in the study were 18 DNA microsatellites which were identified in pig genome. The number of alleles of those DNA microsatellites ranged form a minimum of 3 to maximum of 6. The heterozygote frequency ranged from 0.44 to 0.69. Effective number of alleles for each DNA microsatellotes were 2 to 4. By choosing 6 candidate genetic markers among all, the traceability of individual identification was estimated as accurate as 99.99%(p>0.0014), nearly.
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