다이나믹 정보 디자인을 활용한 단백질 네트워크 시각화 연구
A Study on Protein Networks Visualization Using Dynamic Infographics
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다양한 정보가 범람하는 빅데이터 시대에 접어들면서 적절하게 데이터를 활용하는 능력과 데이터를 분류하고 표현하는 정보 디자인의 역할이 강조되고 있다. 수백 명의 환자, 수백만 개의 단백질 등의 빅데이터를 다루는 단백질체학에서도 시각화 시스템에 대한 연구를 꾸준히 하고 있지만, 아직 노드와 엣지를 기반으로 한 2D 네트워크 형태에만 머물러 있었다. 본 연구는 단백질체학의 관점에서 정상인과 암환자의 데이터 비교를 시각화하면서 기존 단백질 네트워크 시각화에 다이나믹 정보 디자인 요소를 추가하여 새로운 시각화에 대한 가능성을 연구하고자 한다. 전립선 암환자의 확보된 데이터 샘플을 바탕으로 암 상태 단계별(Cancer stage) 단백질의 변이를 다이나믹 네트워크 구조로 표현하며, 이를 시각화하는 프로토타입 툴을 제안한다. 본 연구는 기존 의료 연구에서 중요하게 인지되었지만 표현되지 못했던 시간과 공간 데이터를 3D 공간에 표현함으로써 통합적인 관점으로 정보를 전달하는 방향을 제시하고 있다.
Abstract
We are now in the era of big data, where a variety of information are overflowing, and the information design’s role became quite significant in categorizing and expressing types of data. Proteomics, where millions of protein data are managed, is also in a process of visualizing data, but it still remains in a 2D network form with nodes and edges. In this study, we are adding dynamic infographics on existing protein network visualization in order to suggest a new insight into visualizing system. In a prototype visualization tool suggested in this paper, the dynamic network structure presenting different cancer stages, based on data samples of a prostatic cancer patient, has been visualized. In this way, this paper aims to suggest a new and integrated way of delivering spatial and temporal information of biomedical data in 3D space, which conveys important meanings but has not been presented in the previous visualization system.
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