본문 바로가기
KERD
논문KCI 등재

결핵균과 비결핵 항산균 검출을 위한 AdvanSure TB/NTM Plus Real-Time PCR의 평가

Evaluation of the AdvanSure TB/NTM Plus Real-Time PCR Assay for the Simultaneous Detection of Mycobacterium tuberculosis and Nontuberculous Mycobacteria from Clinical Specimens

정혜선|이미애|함초롱|소민경
대한임상미생물학회 (Korean Society of Clinical Microbiology)|2020.06|Annals of Clinical Microbiology|제23권 제2호|pp. 1-12|DOI 10.5145/ACM.2020.23.2.7

2

조회

0

다운로드

0

인용

0

참고문헌

키워드

TuberculosisPolymerase chain reactionMycobacterium

초록

배경: AdvanSure TB/NTM plus real-time PCR (AdvanSure plus PCR; LG Chem., Korea)는 최근에 소개된 분자 진단 방법으로 다양한 검체에서 빠르게 결핵균(Mycobacterium tuberculosis)과 비결핵항산균(nontuberculous mycobacteria, NTM)을 동시에 검출할 수 있는 방법이다. AdvanSure plus PCR 검사 키트는 기존의 AdvanSure TB/NTM real-time PCR (AdvanSure PCR; LG Chem., Korea) 검사 키트와 비교하여 검출부위를 변경하여 중복 감염 시 소량의 NTM을 검출할 수 있게 하여 NTM 진단의 민감도를 높여 개발되었다. 이번 연구에서는 AdvanSure plus PCR 검사 키트와 AdvanSure PCR 검사 키트의 성능을 항산균 배양 결과와 비교 및 평가해 보고자 한다. 방법: 총 결핵균 혹은 NTM 감염이 의심되는 환자로부터 얻어진 199개의 임상 검체로 AdvanSure plus PCR, AdvanSure PCR, 항산균 도말 검사, 항산균 배양 검사를 시행하였다. 또한 항산균 배양을 통해 결핵균 혹은 NTM이 동정된 200개의 DNA 검체를 이용하여 AdvanSure plus PCR 키트를추가적으로 평가하였다. 결핵균 100개와 NTM 100개를 포함하였으며, NTM의 균종은 다음과같다 (M. intracellulare (n=37), M. avium (n=28), M. abscessus (n=14), M. gordonae (n=6), M. fortuitum (n=5), M. kansasii (n=4) 기타 (n=26)). 항산균 배양 결과를 기준으로 하여, AdvanSure plus PCR 키트와 AdvanSure PCR 키트의 민감도와 특이도를 비교하였다. 결과: 실시간 중합효소연쇄반응법 시스템을 이용한 두 방법간의 일치율은 94.0% (187/199)였다(Kappa=0.94). 항산균 배양 결과를 기준으로 하였을 때, AdvanSure plus PCR 키트의 결핵균 검출에대한 민감도는 100% (45/45)이고 특이도는 83.8% (129/154)였으며, AdvanSure PCR 키트는 100%(45/45)와 99.3% (153/154)였다. 또한 NTM 검출에 있어서 AdvanSure plus PCR 키트의 민감도는68.0% (17/25), 특이도는 90.2% (157/174)이며, AdvanSure PCR 키트는 민감도 64.0% (16/25), 특이도95.4% (166/174)를 보였다. 배양 양성 검체를 대상으로 했을 때, 100개의 결핵균 검체와 100개의NTM 검체 모두 각각 AdvanSure plus PCR 키트에서 양성을 보였으며, 이중 7개의 검체는 혼합 양성을 보였다. 결론: 실시간 중합효소연쇄반응법을 이용한 AdvanSure PCR과 AdvanSure plus PCR은 모두 결핵균을 검출하는데 민감도가 매우 높았으나, NTM을 검출함에 있어서는 덜 민감하였다. AdvanSure plus PCR의 검출에 AdvanSure PCR보다 민감하여 임상검체와 배양균주에서 결핵균과 NTM을 동시 검출하는 방법으로 사용할 수 있음을 확인하였다.

Abstract

Background: The AdvanSure TB/NTM plus real-time PCR (AdvanSure plus PCR; LG Chem., Korea) assay has been developed to increase the diagnostic sensitivity of nontuberculous mycobacteria (NTM) compared with the currently used the AdvanSure TB/NTM real-time PCR (AdvanSure PCR; LG Chem., Korea) assay. In this study, we aimed to evaluate the performance of the AdvanSure plus PCR comparing the results with mycobacterial culture and the AdvanSure PCR. Methods: Patients (n=199) with suspected NTM or Mycobacterium tuberculosis complex (MTC) were tested using AdvanSure plus PCR, AdvanSure PCR, acid-fast bacilli staining, and mycobacteria culture. Additionally, 200 DNA samples (n=100, MTC and n=100, NTM) were obtained from positive MTC or NTM cultures for evaluation using the AdvanSure plus PCR assay. Results: The two real-time PCR systems showed a 94.0% (n=187/199) concordance rate (Kappa=0.94). Based on culture results, the sensitivity and specificity for the detection of MTC were 100% (45/45) and 83.8% (129/154) using AdvanSure plus PCR, and 100.0% (45/45) and 99.3% (153/154) using AdvanSure PCR, respectively. The sensitivity and specificity for NTM detection were 68.0% (n=17/25) and 90.2% (n=157/174), respectively, with AdvanSure plus PCR, and 64.0% (n=16/25) and 95.4% (n=166/174), respectively, using AdvanSure PCR. With culturepositive samples, AdvanSure plus PCR tested positive for 100% of both the MTC and NTM specimens. Seven (out of 200) culture-positive samples tested positive for both MTC and NTM using the AdvanSure plus PCR. Conclusion: AdvanSure plus PCR had increased sensitivity but decreased specificity compared with AdvanSure PCR for the detection of NTM. The AdvanSure plus PCR assay can be used for the simultaneous detection of MTC and NTM in direct specimen and culture.

참고문헌 (22)

  1. "Diagnostic standards and classification of tuberculosis in adults and children. This official statement of the American thoracic society and the centers for disease control and prevention was adopted by the ATS board of directors, July 1999. This statement was endorsed by the council of the Infectious disease society of America, september 1999", Am J Respir Crit Care Med, 161, pp.1376~1395 (2000)
  2. Lee H, "Epidemiology of nontuberculous mycobacterial infection, South Korea, 2007-2016", Emerg Infect Dis, 25, pp.569~572 (2019)
  3. Dye C, "Evolution of tuberculosis control and prospects for reducing tuberculosis incidence, prevalence, and deaths globally", JAMA, 293, pp.2767~2775 (2005)
  4. "Global tuberculosis report 2019"[URL]
  5. Levy H, "A reevaluation of sputum microscopy and culture in the diagnosis of pulmonary tuberculosis", Chest, 95, pp.1193~1197 (1989)
  6. Ritchie SR, "New recommendations for duration of respiratory isolation based on time to detect Mycobacterium tuberculosis in liquid culture", Eur Respir J, 30, pp.501~507 (2007)
  7. Greco S, "Diagnostic accuracy of in-house PCR for pulmonary tuberculosis in smear-positive patients : meta-analysis and metaregression", J Clin Microbiol, 47, pp.569~576 (2009)
  8. Bartlett JM, "A short history of the polymerase chain reaction", Methods Mol Biol, 226, pp.3~6 (2003)
  9. 김서우, "The Effectiveness of Real-Time PCR Assay, Compared with Microbiologic Results for the Diagnosis of Pulmonary Tuberculosis", Tuberculosis and Respiratory Diseases, 78(1), pp.1~7 (2015), 대한결핵및호흡기학회
  10. Drosten C, "Detection of Mycobacterium tuberculosis by real-time PCR using pan-mycobacterial primers and a pair of fluorescence resonance energy transfer probes specific for the M. tuberculosis complex", Clin Chem, 49, pp.1659~1661 (2003)
  11. 정채림, "Clinical Usefulness of Real-time PCR and Amplicor MTB PCRAssays for Diagnosis of Tuberculosis", Annals of Clinical Microbiology, 11(1), pp.29~33 (2008), 대한임상미생물학회
  12. Ho TBL, "Comparison of Mycobacterium tuberculosis genomes reveals frequent deletions in a 20 kb variable region in clinical isolates", Int J Genomics, 1, pp.272~282 (2000)
  13. Talarico S, "Insertion-and deletion-associated genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis phospholipase C-encoding genes among 106 clinical isolates from Turkey", J Clin Microbiol, 43, pp.533~538 (2005)
  14. Gordon SV, "Identification of variable regions in the genomes of tubercle bacilli using bacterial artificial chromosome arrays", Mol Microbiol, 32, pp.643~655 (1999)
  15. 왕혜영, "도말 양성 임상검체에서 MolecuTech Real MTB-ID을 이용한 결핵균과 비결핵균의 검출평가", Annals of Clinical Microbiology, 14(3), pp.103~109 (2011), 대한임상미생물학회
  16. Mäkinen J, "Evaluation of a novel strip test, GenoType Mycobacterium CM", AS, for species identification of mycobacterial cultures, 2006, pp.12, 481~483
  17. 황상선, "LG AdvanSure TB", NTM Real-Time PCR Kit의 항산균 진단 수행 능력 평가, 2011, pp.14(2), 55~59[DOI]
  18. Mdivani N, "Monitoring therapeutic efficacy by real-time detection of Mycobacterium tuberculosis mRNA in sputum", Clin Chem, 55, pp.1694~1700 (2009)
  19. Rosso F, "Evaluation of realtime PCR of patient pleural effusion for diagnosis of tuberculosis", BMC Res Notes, 4, pp.279~ (2011)
  20. Thomsen VO, "Monitoring treatment of patients with pulmonary tuberculosis: can PCR be applied?", J Clin Microbiol, 37, pp.3601~3607 (1999)
  21. Forbes BA, "Practice guidelines for clinical microbiology baboratories : mycobacteria", Clin Microbiol Rev, 31, pp.e00038-17~ (2018)
  22. Min JW, "Real-time polymerase chain reaction in bronchial aspirate for rapid detection of sputum smear-negative tuberculosis", Int J Tuberc Lung Dis, 14, pp.852~858 (2010)

관련 논문AI추천

LG AdvanSure TB/NTM Real-Time PCR Kit의 항산균 진단 수행 능력 평가어영, 김영근, 김효열, 오기진, 윤갑준, 장인호, 황상선대한임상미생물학회 · Annals of Clinical Microbiology2011 · 제14권 제2호Clinical Usefulness of Real-time PCR and Amplicor MTB PCRAssays for Diagnosis of Tuberculosis김미경, 서동춘, 이미애, 정채림대한임상미생물학회 · Annals of Clinical Microbiology2008 · 제11권 제1호항산균 검출을 위한 세가지 실시간 중합효소연쇄반응 시약의 진단 성능 평가고영진, 김상욱, 김윤호, 김창현, 박영희, 임채승대한임상미생물학회 · Annals of Clinical Microbiology2020 · 제23권 제2호Performance Evaluation of Anyplex plus MTB/NTM and AdvanSure TB/NTM for the Detection of Mycobacterium tuberculosis and Nontuberculous Mycobacteria김이화, 박서연, 채정돈, 최원호대한임상미생물학회 · Annals of Clinical Microbiology2015 · 제18권 제2호Comparison of AdvanSure TB/NTM PCR and COBAS TaqMan MTB PCR for Detection of Mycobacterium tuberculosis Complex in Routine Clinical Practice기승정, 서순팔, 신종희, 양동욱, 원은정, 조원형, 최현정대한진단검사의학회 · Annals of Laboratory Medicine2015 · 제35권 제3호호흡기 검체를 이용한 AdvanSure TB/NTM Real Time PCR Kit의 항산균 진단 능력평가김경희, 김신영, 김영진, 김형회, 박미영, 이은엽, 장철훈, 정윤성, 조선아, 황상현대한진단검사의학회 · Annals of Laboratory Medicine2008 · 제28권 제1호

이 간행물의 다른 논문 (6건)

항산균 검출을 위한 세가지 실시간 중합효소연쇄반응 시약의 진단 성능 평가박영희, 김창현, 김윤호, 고영진, 김상욱, 임채승pp. 1-12바이러스 유전자 검사 표준물질의 종류, 제조 및 검증김현수, 이은진, 차영길, 차영주, 홍기호, 이누리, 허희진, 조은정pp. 1-10국내 종합병원에서 발생한 KPC-2 생성 Klebsiella pneumoniae 집단 발생에 대한 역학 분석 연구이경화, 김도균, 정석훈, 홍준성, 박별이, 김건한, 조난형pp. 1-12Killing Dynamics of Carbapenems against Pseudomonas aeruginosa Harboring Varied Determinants of Carbapenem Resistance이은정, 윤은정, 정석훈, VIGA ROLLYpp. 1-8국제 논문 색인 등재를 위한 새출발정혜선, 용동은pp. 1-2
원문 보기