인체자원정보의 의미론적 상호운용성을 위한 LOINC 매핑 프레임워크 개발
Development of a LOINC mapping framework for the semanticinteroperability of bioresources in Korea
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초록
본 연구의 목적은 인체자원은행의 이용자 간에 고품질 대량의 인체자원정보를 정확하게 공유 및 활용하기 위해 이용자에게 검체항목 검색 및 LOINC 매핑 기능을 제공하는 맞춤형 LOINC 매핑 도구를 개발하는 것이다. 매핑 도구는 현재 인체자원은행에서 이용하고 있는 검체항목을 매핑 및 유지 보수하기 위해 선행 연구의 통합 데이터베이스에 포함된 8개 검체영역 테이블을 이용하였다. 또한 이용자에게 다양한 검색 기능을 제공하기 위해 동적 쿼리 알고리즘을 설계하였고, 영문 약어로 표현되는 LOINC의 속성에 대해 한글 번역을 수행하였다. 개발한 도구는 Java 프로그래밍 언어에 기반하여 MySQL Server 5.6으로 개발된 통합 데이터베이스와 연동하기 위해 JDBC Connector를 이용하였고, 유저 인터페이스는 SWING으로 구현하였다. 따라서 이용자는 개발한 도구를 이용하여 검체항목을 LOINC로 매핑하고 관리함으로써 인체자원정보의 활용 및 공유에 있어 반드시 해결되어야 하는 의미론적 상호운용성을 보장할 수 있다.
Abstract
This study developed a customized LOINC mapping toolkit that provides the user with searching specimen items and mapping LOINC in order to share accurately and take advantage of the massive high-quality bio data information among the users of biobank. The mapping toolkit used eight specimen tables that contain the integrated database of the previous research for mapping and maintaining the specimen items that are currently used in biobank. In addition, the mapping toolkit designed the dynamic query algorithm to provide the user with the various search functions, and it performed Korean translation about the attribute of the LOINC represented in english abbreviation. The developed toolkit used the JDBC Connector to connect integrated database developed as MySQL Server 5.6 based on Java programming language and the user interface implemented SWING. Therefore, user can ensure the semantic interoperability that must be resolved in using and sharing the bio data information by mapping and maintaining the specimen items as LOINC by using a developed toolkit.
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