한우 PPARγ 유전자의 동정과 mRNA의 발현
Molecular Cloning and mRNA Expression of the Bovine Peroxisome Proliperator Receptor Gamma(PPARγ)
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초록
지방세포분화 과정에서 중추적인 역할을 한다고 보고되어지고 있는 PPARγ 유전자를 cloning 하기 위하여 한우 12개월 지방조직을 이용하여 Total RNA를 추출하고 RT-PCR을 수행하여 1515bp, 505 아미노산 서열을 가진 PPARγ 유전자를 cloning하였다. bovine을 제외한 다른 4종의 다른 동물과는 아미노산 서열을 비교한 결과 모두 90% 이상의 상동성을 나타내었다. 특히 NCBI에 보고된 Norwegian cattle PPARγ (NCBI Accession No. O18971)의 아미노산 서열과 비교한 결과 99.2%의 상동성을 나타내었으며 아미노산 서열중 81번째 이소루신, 140번째 아르기닌, 157번째 글루탐산, 486번째 리신이 각각 트레오닌, 트립토판, 글리신, 이소루신으로 치환된 상태의 아미노산 서열을 나타내었다. 특히 nuclear hormone receptor의 DNA binding domain 영역에 포함되는 140번째, 157번째 아미노산의 치환은 앞으로 한우 PPARγ 유전자가 조절하는 다른 유전자와의 관계를 밝히는데 매우 중요한 점이 될 것으로 사료되어진다. 한우 PPARγ의 발현은 지방조직에서 매우 높은 발현을 보였으며, 한우 12개월령과 30개월령 지방조직에서의 PPARγ 발현을 비교분석하였을 때 12개월령에서보다 30개월령 지방조직에서 PPARγ 발현이 약 6배정도 높았다. 이와 같은 결과는 한우 PPARγ 유전자도 사람과 생쥐에서와 같이 지방분화에 관여하고 있다는 보고와 일치하는 결과라고 사료된다.
Abstract
The peroxisome proliferator-activated receptor γ(PPARγ), a member of the steroid/thyroid nuclear hormone receptor suferfamily of ligand-activated transcription factor, is an important regulator of adipocyte gene expression and differentiation. In this studies, we report the identification, characterization, and expression of a Hanwoo PPARγ gene. The PPARγ cDNA sequence of the Hanwoo show strong conservation with the corresponding sequences reported in other species except of three amino acid sequences. The distribution of PPARγ mRNA in various tissues of Korean cattle aged 12 months were investigated using Northern Blot analysis. The highest expression was detected in adipose tissue, more lower expression was detected in colon, small intestine, kidney, lung, while expression was not detected in brain, heart. PPARγ expression was higher in adipose tissue of Korean cattle when aged 30 months than aged 12 months. These results indicated PPARγ, regulator adipocyte gene expression and differentiation, related on adipose differentiation in Korean native cattle(HANWOO).
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