미국가재 (Procambarus clarkii ) 수족관 개체군 및 국내 침입 자연개체군의 유전적 변이 연구
Investigation of genetic variability in commercial and invaded natural populations of red swamp crayfish (Procambarus clarkii ) from South Korea
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미국과 멕시코 지역이 원산지로 알려진 미국가재는 세계적인 침입종으로서, 최근 국내에서도 자연개체군의 출현과 개체수의 증가가 보고되어왔다. 본 연구에서는 미토콘드리아 COI 유전자 및 초위성체 마커를 이용하여, 다양한 체색을 포함한 침입 자연개체군, 유입경로로 추정되는 수족관 개체군, 원산지 개체군인 미국 개체군의 유전자 다양성 및 집단유전학 분석을 수행하였다. 미토콘드리아 COI 유전자 다양성 분석 결과, 국내에서 채집된 침입 자연개체군 (33개체)과 수족관 개체군 (226개체)에서 5개의 단상형만이 발견되었으며, 초위성체 마커를 이용한 집단유전학 분석 결과에서도 침입 자연개체군과 수족관 개체군은 낮은 유전자 다양성을 나타냈다. 미국 개체군의 유전자 다양성은 두 마커에서 모두 높게 나타났는데, 이는 일반적으로 원산지 (source population) 개체군이 높은 유전자 다양성을 가지는 특성을 보여준다고 할 수 있다. 본 연구에서 미국 개체군에서 수족관 개체군으로 그리고 침입 자연개체군으로 유입된 경로를 직접적으로 보여주지는 않으나, 모든 개체군에서 공유되는 COI 단상형 (haplotype)과 낮은 유전적 분화도 (FST)로 볼 때, 원산지인 미국으로부터 수입된 개체들이 각기 다른 수족관을 통해 침입 자연개체군으로 유입되었을 가능성을 보여준다. 특히 수족관 개체군은 많은 개체수임에도 불구하고, 매우 낮은 유전적 다양성을 보임으로써 창시자 효과 후 inbreeding에 의한 개체군일 가능성을 보여주며, 이는 소수의 개체로부터 대량 증식되었을 가능성을 보여준다. 또한 서로 다른 체색을 띠는 수족관 개체들은 체색에 따른 유전적 차이는 없었다. 다만 주홍색 가재와 흰색 가재에서 더 높은 inbreeding이 나타났을 가능성을 보여준다. 따라서 자연개체군의 체색의 경우 수족관 개체의 특정 체색으로부터 유입되었다기보다는 자연환경에서 적응에 의해 나타난 변화의 가능성이 높다고 할 수 있다. 또한 침입 자연개체군의 낮은 유전적 다양성으로 볼 때 초기 국내 자연개체군의 유효집단 (effective population)의 크기는 크지 않을 것으로 보이며, 근거리에 위치한 두 침입 자연개체군의 비교적 큰 유전적 분화도 결과로 볼 때 두 침입 자연개체군의 유전적 흐름보다는, 원산지인 미국의 다양한 유전자형이 다양한 국내 지역 수족관으로 유입되고, 이후 각각 다른 경로를 통해 각각의 자연개체군을 형성했을 것으로 보인다. 이는 본 연구에 포함되지 않은 다른 유입경로가 있음을 보여주며, 대량 사육되어 판매되는 미국가재가 자연개체군으로 유입되었을 가능성을 나타낸다. 본 연구 결과에서 얻은 미국 개체군, 국내 수족관 개체군, 국내 침입 자연개체군의 유전자 다양성 및 집단유전학 연구는 개체군 증가와 확산이 우려되는 국내 침입 자연개체군의 크기 및 유입경로를 추론하는 데 중요한 정보가 될 것이며, 이후 국내 자연개체군 대량 발생의 분석과 모니터링에 활용될 수 있을 것이다.
Abstract
The invasive red swamp crayfish, Procambarus clarkii, is native to southcentral United States and northeastern Mexico. Recently, it has been being spreading in the wild in South Korea. However, its primary sources, introduction routes, establishment, and expansion in South Korea remain unclear. Here, we analyzed genetic diversity and population genetic structures of its domestic natural populations during early invasion, commercial stock from local aquaria (a suspected introduction source), and original United States population using mitochondrial COI gene sequences for 267 individuals and eight microsatellite markers for 158 individuals. Natural and commercial populations of P. clarkii showed reduced genetic diversity (e.g., haplotype diversity and allelic richness). The highest genetic diversity was observed in one original source population based on both genetic markers. Despite a large number of individuals in commercial aquaria, we detected remarkably low genetic diversity and only three haplotypes among 226 individuals, suggesting an inbred population likely originating from a small founder group. Additionally, the low genetic diversity in the natural population indicates a small effective population size during early establishment of P. clarkii in South Korea. Interestingly, genetic differentiation between natural populations and the United States population was lower than that between natural populations and aquarium populations. This suggests that various genetic types from the United States likely have entered different domestic aquariums, leading to distinct natural populations through separate pathways. Results of our study will provide an insight on the level of genetic divergence and population differentiation during the initial stage of invasion of non-indigenous species into new environments.
참고문헌 (32)
- Alessandra Maria Bissattini, "Tolerance of increasing water salinity in the red swamp crayfish Procambarus clarkii(Girard, 1852)", Journal of Crustacean Biology, 35(5), pp.682~685 (2015), Oxford University Press (OUP)[DOI]
- Christina M. Carr, "A Tri-Oceanic Perspective: DNA Barcoding Reveals Geographic Structure and Cryptic Diversity in Canadian Polychaetes", PLoS ONE, 6(7), pp.e22232~ (2011), Public Library of Science (PLoS)[DOI]
- Catherine Souty-Grosset, "The red swamp crayfish Procambarus clarkii in Europe: Impacts on aquatic ecosystems and human well-being", Limnologica, 58, pp.78~93 (2016), Elsevier BV[DOI]
- Jong-Yun Choi, "Invasion and Dispersion of the Exotic Species Procambarus clarkii (Decapoda Cambaridae) in Yeongsan River Basin, South Korea", Animals, 11(12), pp.3489~ (2021), MDPI AG[DOI]
- G. EVANNO, "Detecting the number of clusters of individuals using the software <scp>structure<", scp>: a simulation study, 2005, pp.14(8), 2611~2620[DOI]
- LAURENT EXCOFFIER, "Arlequin suite ver 3.5: a new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows", Molecular Ecology Resources, 10(3), pp.564~567 (2010), Wiley[DOI]
- Sara Ghabooli, "Multiple introductions and invasion pathways for the invasive ctenophore Mnemiopsis leidyi in Eurasia", Biological Invasions, 13(3), pp.679~690 (2010), Springer Science and Business Media LLC[DOI]
- "FSTAT, a program to estimate and test gene diversity and fixation indices (version 2.9.3)" (2001)[URL]
- Hartl D, "Principles of Population Genetics" (2007), Sinauer Associates
- Phillip J. Haubrock, "Burrowing activity of Procambarus clarkii on levees: analysing behaviour and burrow structure", Wetlands Ecology and Management, 27(4), pp.497~511 (2019), Springer Science and Business Media LLC[DOI]
- Paul D. N. Hebert, "Biological identifications through DNA barcodes", Proceedings of the Royal Society of London. Series B: Biological Sciences, 270(1512), pp.313~321 (2003), The Royal Society[DOI]
- Jinlong Huang, "Microsatellite evidence of dispersal mechanism of red swamp crayfish (Procambarus clarkii) in the Pearl River basin and implications for its management", Scientific Reports, 7(1), pp.8272~ (2017), Springer Science and Business Media LLC[DOI]
- Ji Eun Jang, "Genetic evidence for sex-biased dispersal and cryptic diversity in the greater horseshoe bat, Rhinolophus ferrumequinum", Biodiversity and Conservation, 30(3), pp.847~864 (2021), Springer Science and Business Media LLC[DOI]
- 정상우, "생물모니터링 및 환경유전자(eDNA)를 이용한 침입외래종 미국가재(Procambarus clarkii)의 한국분포 현황", 한국환경생태학회지, 36(4), pp.368~380 (2022), 한국환경생태학회
- Ji Hyoun Kang, "Population genetic structure of a recent insect invasion: a gall midge, Asynapta groverae (Diptera: Cecidomyiidae) in South Korea since the first outbreak in 2008", Scientific Reports, 13(1), pp.2812~ (2023), Springer Science and Business Media LLC[DOI]
- A Study of Detailed Survey on Invasive Alien Species in Korea and Designation of Invasive Alien Species in Foreign Countries, "Kim JM", National Institute of Environmental Research, 408~ (2006)
- 김수환, "외래생물 미국가재 (Procambarus clarkii)의 국내 자연생태계 정착 보고", 생태와 환경, 52(4), pp.333~339 (2019), 한국수생태학회[DOI]
- 김유림, "한국 고유 담수어종 참갈겨니 (Zacco koreanus) 개체군의 계통지리학 및 집단유전학 연구", 환경생물, 38(4), pp.650~657 (2020), 한국환경생물학회[DOI]
- 이대성, "미국가재 (Procambarus clarkia)의 국내 출현 및 잠재 분포 지역 평가", 생태와 환경, 52(4), pp.340~347 (2019), 한국수생태학회[DOI]
- Le Roux J, "Molecular systematics and population genetics of biological invasions : towards a better understanding of invasive species management", Ann. Appl. Biol, 154, pp.1~17 (2009)
- Research on the Features of Environmentally Issued Animals (II), "NIBR", National Institute of Biological Resources, 105~, pp.No. 11-1480592-001732-01 (2020)
- Francisco J. Oficialdegui, "One century away from home: how the red swamp crayfish took over the world", Reviews in Fish Biology and Fisheries, 30(1), pp.121~135 (2020), Springer Science and Business Media LLC[DOI]
- 박철우, "생태계교란 생물 미국가재 (Procambarus clarkii)의 국내 서식과 분포 연구", 생태와 환경, 53(4), pp.331~335 (2020), 한국수생태학회[DOI]
- Nadia I. Richman, "Multiple drivers of decline in the global status of freshwater crayfish (Decapoda: Astacidea)", Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 370(1662), pp.20140060~ (2015), The Royal Society[DOI]
- Rousset F, "GENEPOP’007: a complete re-implementation of the GENEPOP software for Windows and Linux", Mol. Ecol. Resour, 8, pp.103~106 (2008)[DOI]
- Julio Rozas, "DnaSP 6: DNA Sequence Polymorphism Analysis of Large Data Sets", Molecular Biology and Evolution, 34(12), pp.3299~3302 (2017), Oxford University Press (OUP)[DOI]
- Investigating Ecological Risk of Alien Species (V), "Song, HR", National Institute of Ecology, 89~ (2018)
- 송재준, "침입생물 연구에 대한 메타개체군 이론의 활용 가능성: 침입 성공을 중심으로", 환경생물, 40(4), pp.525~549 (2022), 한국환경생물학회
- Carol A. Stepien, "Genetic Diversity of Invasive Species in the Great Lakes Versus Their Eurasian Source Populations: Insights for Risk Analysis", Risk Analysis, 25(4), pp.1043~1060 (2005), Wiley[DOI]
- A. G. F. TEACHER, "HapStar: automated haplotype network layout and visualization", Molecular Ecology Resources, 11(1), pp.151~153 (2010), Wiley[DOI]
- Van Oosterhout C, "MICRO-CHECKER: software for identifying and correcting genotyping errors in microsatellite data", Mol. Ecol. Resour, 4, pp.535~538 (2004)[DOI]
- Shaokui Yi, "Characterization of Population Genetic Structure of red swamp crayfish, Procambarus clarkii, in China", Scientific Reports, 8(1), pp.5586~ (2018), Springer Science and Business Media LLC[DOI]
