Staphylococcus aureus 검출을 위한 새로운 PCR primer의 개발
Development of a Novel PCR Primer for Detection of Staphylococcus aureus
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초록
본 연구는 S. aureus을 신속하게 검출할 수 있는 PCR primer를 개발하고자 실시되었다. S. aureus를 포함한 Clostridium, Escherichia, Salmonella, Shigella, Vibrio, Bifidobacteria, Lactobacillus,Streptococcus 등 그람 양성 및 그람 음성 균주 17 종의 genomic DNA를 대상으로 20종의 랜덤primer들을 사용하여 PCR을 실시하였다. S. aureus의 특이적 밴드를 선발하여 DNA 염기 서열을 분석하였고 이를 바탕으로 5쌍의 primer를 제작하였으며 그 중 primer SYU-5를 사용하여 PCR을 실시할경우, 단일 밴드로 나타나는 다른 균주들에 비해 S. aureus 균주에서 약 250, 550 및 850 bp 크기의세 개 밴드들이 검출되었다. 또한, S. aureus가 첨가된 8종 균주들의 genomic DNA 혼합 용액과 각종유제품 및 분쇄육을 대상으로 primer SYU-5의 특이적 검출능을 확인하였다. 본 연구에서 사용한 PCR기법은 기존의 선택배지 배양법과 비교하여 시간 및 노동력 측면에서 식중독 유발 S. aureus의 검출에보다 효과적인 방법으로 사용 가능하였다. 또한, 본 연구의 결과는 다양한 병원균들의 특이적 검출을위한 PCR 기법 개발에 기초 자료를 제공할 수 있다.
Abstract
Staphylococcal intoxication is considered to be one of the most frequently occurring foodbornediseases worldwide, and a rapid and reliable method for the identification of staphylococci isneeded. In this study, we developed specific PCR primers for Staphylococcus aureus strain byinvestigating the PCR band patterns distinguished from different bacterial species includingClostridium, Escherichia, Salmonella, Shigella, Vibrio, Bifidobacteria, Lactobacillus andStreptococcus. The sensitivity tests using the genomic DNAs mixture, dairy foods and groundmeats revealed that the primer SYU-5 was specific for the detection of Staphylococcus aureusby showing about 250, 550 and 850 bp bands on agarose gel, which might be used for theinitial and rapid identification of S. aureus from the clinical isolates.
참고문헌 (15)
- Abazar P., "PCR-based indentification of methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains and their antibiotic resistance prifiles", Asian Pac J Trop Biomed, 4, pp.293~297 (2014)
- Alarcon B., "PCR-based procedure for detection and quantification of Staphylococcus aureus and their application in food", J Appl Microbiol, 100, pp.352~364 (2006)
- 배현주, "즉석섭취 샌드위치류의 황색포도상구균에 대한 위해분석", 한국식품영양과학회지, 36(7), pp.938~943 (2007), 한국식품영양과학회
- Gao J., "Development of multiplex polymerase chain reaction assay for rapid detection of Staphylococcus aureus and selected antibiotic resistance genes in bovine mastitic milk samples", J Vet Diagn Invest, 23, pp.894~901 (2011)
- Hwang B. H., "Polymerase chain reaction-based detection of total and specific Vibrio species", Appl Biochem Biotech, 162, pp.1187~1194 (2010)
- 정유석, "Multiplex Polymerase Chain Reaction(PCR)법을 이용한 Staphylococcus aureus, Salmonella enterica subsp., Vibrio parahaemolyticus의 다중동시검출", 한국식품영양과학회지, 39(4), pp.595~601 (2010), 한국식품영양과학회
- 정혜진, "상추와 원유에서 분리한 황색 포도상구균의 유전형 및 표현형 특징", 한국식품과학회지, 37(1), pp.134~141 (2005), 한국식품과학회
- 김홍석, "유제품과 육제품에서 황색포도상구균 신속검출을 위한 PCR법의 비교검증", 한국식품과학회지, 45(6), pp.791~795 (2013), 한국식품과학회[DOI]
- Kennedy A. D., "Epidemic communityassociated methicillin-resistant Staphylococcus aureus: recent clonal expansion and diversification", Proc Natl Acad Sci USA, 105, pp.1327~1332 (2008)
- 이재훈, "가공식품과 비가공식품에서의 황색포도상구균 검출을 위한 배지법과 Real-time PCR법의 비교", 한국축산식품학회지, 30(3), pp.410~418 (2010), 한국축산식품학회
- Palomares C., "Rapid detection and identification of Staphylococcus aureus from blood culture specimens using real-time fluorescence PCR", Diagn Microbiol Infect Dis, 45, pp.183~189 (2003)
- Young Gon Kim, "Detection of Escherichia coli O157:H7, Salmonella spp.,Staphylococcus aureus and Listeria monocytogenes in Kimchi byMultiplex Polymerase Chain Reaction (mPCR)", The Journal of Microbiology, 44(1), pp.92~97 (2006), 한국미생물학회
- Strommenger B., "Multiplex PCR for rapid detection of Staphylococcus aureus Isolates suspected to represent community-acquired strains", J Clin Microbiol, 46, pp.582~587 (2008)
- Tiemersma E. W., "Methicillin-resistant Staphylococcus aureus in Europe", Emerg Infect Dis, 10, pp.1627~1634 (2004)
- 윤장호, "식품에서 Salmonella spp., Yersinia enterocolitica 및 Staphylococcus aureus의 직접검출을 위한 Multiplex PCR", 산업식품공학, 12(1), pp.24~31 (2008), 한국산업식품공학회